RNA–Protein interactions for RNA: YMR156C

TPP1, Transcript of DNA 3'-phosphatase, yeast

Gene TPP1, Length 717 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TPP1	YMR156C	ARP9	Q05123	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	AIM6	Q07716	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	PGC1	Q08959	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	POM34	Q12445	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	SPT7	P35177	1332 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	PET122	P10355	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	GEX2	P36173	615 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	SRO77	P38163	1010 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	YBR259W	P38338	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	JEM1	P40358	645 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	ZAP1	P47043	880 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	COS12	P53053	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	NCS6	P53088	359 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	MTL1	P53214	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	CTI6	Q08923	506 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	HUA2	Q12134	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	SWM1	Q12379	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TPP1	YMR156C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ATG19	P35193	415 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	MET12	P46151	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	SGF73	P53165	657 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	INN1	P53901	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ROT1	Q03691	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	RCO1	Q04779	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	THI22	Q06490	572 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	TMA16	Q08687	178 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	NMD4	Q12129	218 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	KIN82	P25341	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ADK2	P26364	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ALY1	P36117	915 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	UBP13	P38187	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ECM1	P39715	212 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	FLC2	P39719	783 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	JHD1	P40034	492 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	TMN3	P40071	706 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	YJL068C	P40363	299 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	UBP7	P40453	1071 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	YIL077C	P40508	320 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	LCL3	P53153	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	MRPL22	P53881	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	NRG1	Q03125	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	RMT2	Q03305	412 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	SFI1	Q12369	946 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	GRX6	Q12438	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	VCX1	Q99385	411 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	CDC6	P09119	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PMS1	P14242	873 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	APE1	P14904	514 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	MNE1	P24720	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	EMC1	P25574	760 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	AAD3	P25612	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PEP3	P27801	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	GPI10	P30777	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	RPP1	P38786	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	MEP1	P40260	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	CHA4	P43634	648 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	GPI8	P49018	411 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	VPS4	P52917	437 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	RIM8	P53179	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	HOF1	Q05080	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ARR3	Q06598	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	AIM41	Q12032	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	HIS5	P07172	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	CBS1	P14066	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	POL4	P25615	582 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	DCG1	P32460	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	GCS1	P35197	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	APT2	P36973	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	COS111	P38308	924 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	LRO1	P40345	661 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	not detected
TPP1	YMR156C	RFX1	P48743	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	AIM32	Q04689	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	GAD1	Q04792	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	YFT2	Q06676	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	PEX19	Q07418	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	NBP2	Q12163	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	YDL177C	Q12257	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TPP1	YMR156C	ISA2	Q12425	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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