RNA–Protein interactions for RNA: YLR356W

ATG33, Transcript of Mitochondrial mitophagy-specific protein, yeast

Gene ATG33, Length 594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG33	YLR356W	RPL43B	P0CX26	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	MIH1	P23748	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	BEM1	P29366	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	LIP5	P32875	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	ATG10	Q07879	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	FRE7	Q12333	620 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	SFI1	Q12369	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	VPS5	Q92331	675 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ATG33	YLR356W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MNE1	P24720	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RPC25	P35718	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YER130C	P39959	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RAD26	P40352	1085 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ATF2	P53296	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YDR444W	Q04093	687 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YPR109W	Q06104	294 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GPA1	P08539	472 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MPH2	P0CD99	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PPH21	P23594	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SNT1	P25357	1226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RNQ1	P25367	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MRC1	P25588	1096 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MIC60	P36112	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	VRP1	P37370	817 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ALR2	P43553	858 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CNN1	P43618	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YJR124C	P47159	448 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TEP1	P53916	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	STP3	Q05937	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YPR114W	Q06107	315 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SPO75	Q07798	868 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GPR1	Q12361	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PNS1	Q12412	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YOR338W	Q99326	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MTF2	P10849	440 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GAL11	P19659	1081 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	MSH3	P25336	1018 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ADY2	P25613	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	GYP6	P32806	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CYM1	P32898	989 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YKL050C	P35736	922 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ADD66	P36040	267 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PAN6	P40459	309 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CIR1	P42940	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	HXT16	P47185	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PCL10	P53124	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	HXT15	P54854	567 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SND1	Q04007	877 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YDR222W	Q04925	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
ATG33	YLR356W	GPM3	Q12326	303 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	OCA6	Q12454	224 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SEC39	Q12745	709 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TUP1	P16649	713 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	NUD1	P32336	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TDA3	P38758	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CCT6	P39079	546 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	YIR014W	P40570	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	NUP85	P46673	744 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	UBX6	P47049	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TAD1	P53065	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
ATG33	YLR356W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PPN1	Q04119	674 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	TRE2	Q08693	809 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	VPS68	Q12016	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PDR1	P12383	1068 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	KAR3	P17119	729 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	RPC31	P17890	251 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PMA2	P19657	947 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	EXO5	P38289	585 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	SWC5	P38326	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATG33	YLR356W	PCA1	P38360	1216 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.7 ms