RNA–Protein interactions for RNA: YLL053C

YLL053C, Transcript of Putative protein, yeast

Gene YLL053C, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL053C	YLL053C	EAR1	Q03212	550 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YLL053C	YLL053C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
YLL053C	YLL053C	AFI1	Q99222	893 aa		11.34	□□□□□ -0.59
YLL053C	YLL053C	APE1	P14904	514 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	URA10	P30402	227 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	MET22	P32179	357 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	COQ6	P53318	479 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TEP1	P53916	434 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YET3	Q07451	203 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	VHS3	Q08438	674 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YOR387C	Q08910	206 aa		11.33	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	COX5A	P00424	153 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	KIP2	P28743	706 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SRP101	P32916	621 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SLD2	P34252	453 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SAF1	P38352	637 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	BST1	P43571	1029 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	GND2	P53319	492 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ADI1	Q03677	179 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	LDB17	Q12342	491 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	OCA6	Q12454	224 aa		11.32	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	GPA2	P10823	449 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	HMG2	P12684	1045 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	AMS1	P22855	1083 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YCL068C	P25593	260 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ELO3	P40319	345 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	RPN4	Q03465	531 aa		11.31	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PSE1	P32337	1089 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SMI1	P32566	505 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PEX5	P35056	612 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YBR032W	P38223	100 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	REV7	P38927	245 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	VAC8	P39968	578 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	MET14	Q02196	202 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YLR012C	Q07927	99 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SLD7	Q08457	257 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		11.3	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PPH22	P23595	377 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SYN8	P31377	255 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	NDI1	P32340	513 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SQT1	P35184	431 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	KTR4	P38131	464 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ATG12	P38316	186 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	BIO4	P53630	237 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YCS4	Q06156	1176 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	YLR053C	Q12026	108 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SLP1	Q12232	587 aa		11.29	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	HSF1	P10961	833 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PEX34	P25584	144 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	KAR9	P32526	644 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SGE1	P33335	543 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	ADD66	P36040	267 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	RAD26	P40352	1085 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	RRN7	P40992	514 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TDA10	P42938	290 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	TIM13	P53299	105 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	HST2	P53686	357 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	SIW14	P53965	281 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	DOS2	P54858	310 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	PGC1	Q08959	321 aa		11.28	□□□□□ -0.6
YLL053C	YLL053C	INO1	P11986	533 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	YBR062C	P38239	180 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	PEX28	P38848	579 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	YJL107C	P42947	387 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	YGL140C	P53120	1219 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	CDC14	Q00684	551 aa		11.27	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.26	□□□□□ -0.61	not detected
YLL053C	YLL053C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	CDC123	Q05791	360 aa		11.26	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
YLL053C	YLL053C	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 55.6 ms