RNA–Protein interactions for RNA: YKL003C

MRP17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP17, Length 396 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP17	YKL003C	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	SAP185	P40856	1058 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	AIM23	P47015	356 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	EMC4	P53073	190 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	ADI1	Q03677	179 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	RKM2	Q03942	479 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	THI21	Q08975	551 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	ATG9	Q12142	997 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MRP17	YKL003C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	DAL81	P21657	970 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	STL1	P39932	569 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	KHA1	P40309	873 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ATG3	P40344	310 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YJR061W	P40355	935 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RRT5	P43607	289 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	NUP84	P52891	726 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YNR063W	P53749	607 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CDC55	Q00362	526 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	INP2	Q03824	705 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SND1	Q04007	877 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ERG11	P10614	530 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ROX1	P25042	368 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	KAR9	P32526	644 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	APM3	P38153	483 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	PFS1	P38872	237 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ERP2	P39704	215 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	VAC8	P39968	578 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CSN12	P47130	423 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	AIM14	P53109	570 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	UBP2	Q01476	1272 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CIR2	Q08822	631 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	APL4	Q12028	832 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	STB3	Q12427	513 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	PEX11	Q12462	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	IZH4	Q99393	312 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CLC1	P17891	233 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YCR015C	P25616	317 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	PXA2	P34230	853 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ALY1	P36117	915 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	MRPL40	P36534	297 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ATM1	P40416	690 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YPS6	P40583	537 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YGR021W	P53212	290 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.75	□□□□□ -1.49	not detected
MRP17	YKL003C	PRM1	P53835	661 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YNL108C	P53929	270 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ERG5	P54781	538 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	DOS2	P54858	310 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ERV41	Q04651	352 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SWC7	Q06707	132 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	GPM3	Q12326	303 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	MRPL8	P22353	238 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SPC110	P32380	944 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ADD66	P36040	267 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YHR078W	P38799	552 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YEL028W	P39989	153 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	ALY2	P47029	1046 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YJR098C	P47139	656 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	COQ5	P49017	307 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	GRX8	Q05926	109 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	YLR001C	Q07895	862 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	OPI10	Q08202	246 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	OCA6	Q12454	224 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	AFI1	Q99222	893 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	STT4	P37297	1900 aa		5.74	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	RAD10	P06838	210 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	CIN8	P27895	1000 aa		5.73	□□□□□ -1.49
MRP17	YKL003C	MEI4	P29467	408 aa		5.73	□□□□□ -1.49

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