RNA–Protein interactions for RNA: YHL009W-A

YHL009W-A, Transcript of Retrotransposon TYA Gag gene co-transcribed with TYB Pol, yeastyeast

Gene YHL009W-A, Length 1,242 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL009W-AYHL009W-A UBP16Q02863 499 aa3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YML119WQ03208 357 aa3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ARA2Q04212 335 aa3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A HFI1Q12060 488 aa3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YER175W-AQ8TGU4 54 aa3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A NOP14Q99207 810 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A CHO2P05374 869 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A PPG1P32838 368 aa3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RRP14P36080 434 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A SAP1P39955 897 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A MAM1P40065 302 aa3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A BET4Q00618 327 aa3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A PLM2Q04383 521 aa3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RAD34Q06665 692 aa3.19□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A CBP3P21560 335 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A PLC1P32383 869 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RKM3P38222 552 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YJL107CP42947 387 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A TIP41Q12199 356 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ADR1P07248 1323 aa3.18□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A AMD2P22580 549 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ERV46P39727 415 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A ORC5P50874 479 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A PEF1P53238 335 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A MDR1P53258 950 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YLR281CQ05863 155 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A Q0010Q9ZZX9 128 aa3.17□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A AEP2P22136 580 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A NIC96P34077 839 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YND1P40009 630 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A SMA2Q04658 369 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A YML053CQ04978 212 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A APM4Q99186 491 aa3.16□□□□□ -1.9
YHL009W-AYHL009W-A MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A FMP42Q04991 504 aa3.15□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A THI73Q07904 523 aa3.15□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A LCB4Q12246 624 aa3.15□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A HXT4P32467 576 aa3.14□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A ACS1Q01574 713 aa3.14□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A ARN1P38731 627 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A VPS8P39702 1274 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A QRI7P43122 407 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A HLJ1P48353 224 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A COS12P53053 380 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A GPG1P53130 126 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A FCP1Q03254 732 aa3.13□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A DID4P36108 232 aa3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A BZZ1P38822 633 aa3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A LNP1P38878 278 aa3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A YAT1P80235 687 aa3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A YDL242WQ07746 117 aa3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A NGL1Q08213 363 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A CWH43P25618 953 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A MSS51P32335 436 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A DAL3P32459 195 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A GSH1P32477 678 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A PCL6P40038 420 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A YJR142WP47173 342 aa3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A SES1P07284 462 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A ATP12P22135 325 aa3.1□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A GPP1P41277 250 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A VPS25P47142 202 aa3.1□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A CRZ1P53968 678 aa3.1□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A EXO84P38261 753 aa3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A PEA2P40091 420 aa3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A UME1Q03010 460 aa3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A SND1Q04007 877 aa3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A RSA1Q08932 381 aa3.09□□□□□ -1.91
YHL009W-AYHL009W-A ILV2P07342 687 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A CDC23P16522 626 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A MNN2P38069 597 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A IZH1Q03419 316 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YLR352WQ06479 807 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A YLR112WQ12130 139 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A TAH18Q12181 623 aa3.08□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data3.08□□□□□ -1.92not detected
YHL009W-AYHL009W-A SAN1P22470 610 aa3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A SER1P33330 395 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A VBA2P38358 474 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A SRP68P38687 599 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A STB5P38699 743 aa3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A RNR4P49723 345 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A VPS5Q92331 675 aa3.07□□□□□ -1.92
YHL009W-AYHL009W-A ARG1P22768 420 aa3.06□□□□□ -1.92
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