RNA–Protein interactions for RNA: YGR129W

SYF2, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF2, Length 648 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF2	YGR129W	RPN4	Q03465	531 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PPM1	Q04081	328 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	SIL1	Q08199	421 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YPL216W	Q08964	1102 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	HMI1	Q12039	706 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	ECM3	Q99252	613 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RPB10	P22139	70 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	CDC15	P27636	974 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PXA2	P34230	853 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	MIC60	P36112	540 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YMC2	P38087	329 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RGD2	P43556	714 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	BST1	P43571	1029 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TOS3	P43637	560 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YJR079W	P47126	109 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YNL144C	P53907	740 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YML096W	Q04489	525 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YCS4	Q06156	1176 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TLG2	Q08144	397 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	ARP7	Q12406	477 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YOL098C	Q12496	1037 aa		6.06	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	DAL82	P21705	255 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	LIP5	P32875	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	HFM1	P51979	1187 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YPL113C	Q02961	396 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TAF9	Q05027	157 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	BNA5	Q05979	453 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YLR012C	Q07927	99 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	SOG2	Q08817	791 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		6.05	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	SEC6	P32844	805 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	UBS1	P38290	277 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	YJL070C	P40361	888 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	LEM3	P42838	414 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	CIS3	P47001	227 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RTT101	P47050	842 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	SNO2	P53823	222 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	AIM32	Q04689	311 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.04	□□□□□ -1.44	not detected
SYF2	YGR129W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	MDM38	Q08179	573 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RTT10	Q08924	1013 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	APC11	Q12157	165 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	AEP2	P22136	580 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PTP1	P25044	335 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RDS1	P25611	832 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	CIN8	P27895	1000 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	CDC11	P32458	415 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	NTA1	P40354	457 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	THI73	Q07904	523 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	PEX15	Q08215	383 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SYF2	YGR129W	TRA1	P38811	3744 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	JIP3	O13555	125 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PSO2	P30620	661 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PRX1	P34227	261 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CTM1	P38818	585 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ARO80	Q04052	950 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	SRO7	Q12038	1033 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YLR046C	Q12253	270 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YDR061W	Q12298	539 aa		6.02	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	DAL81	P21657	970 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	DAL2	P25335	343 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	GEX1	P25596	615 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YIH1	P25637	258 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CSG2	P35206	410 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	YKL151C	P36059	337 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	GEX2	P36173	615 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	MUM2	P38236	366 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	NEO1	P40527	1151 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	MRX6	P48564	524 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.01	□□□□□ -1.45	not detected
SYF2	YGR129W	PNS1	Q12412	539 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	SUC2	P00724	532 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CYC8	P14922	966 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	OM45	P16547	393 aa		6	□□□□□ -1.45
SYF2	YGR129W	CYM1	P32898	989 aa		6	□□□□□ -1.45

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