RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	YDL242W	Q07746	117 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HIR3	P47171	1648 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MET5	P47169	1442 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	FAA2	P39518	744 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YEL025C	P39991	1188 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	VRG4	P40107	337 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	NUP82	P40368	713 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YIL092W	P40497	633 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MAD2	P40958	196 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	BOR1	P53838	576 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YNL193W	P53870	558 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	BET4	Q00618	327 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YPL071C	Q02864	156 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PIG1	Q06216	648 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YPL216W	Q08964	1102 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TGS1	Q12052	315 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DIN7	Q12086	430 aa		0.75	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MRS3	P10566	314 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YMR210W	Q03649	449 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DSE3	Q08729	430 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YOL098C	Q12496	1037 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DOP1	Q03921	1698 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	REV1	P12689	985 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPL8A	P17076	256 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GEX2	P36173	615 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	EXO84	P38261	753 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YJL193W	P39542	402 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	VID28	P40547	921 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SPG5	P42933	373 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YJR096W	P47137	282 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MNT2	P53059	558 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TAF7	Q05021	590 aa		0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.74	□□□□□ -2.29	not detected
CSE1	YGL238W	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	BI2	P03873	423 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PCT1	P13259	424 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ARG1	P22768	420 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HXT4	P32467	576 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MNN2	P38069	597 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	AVT5	P38176	459 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ARN1	P38731	627 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YIL169C	P40442	995 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CUL3	P53202	744 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	FCP1	Q03254	732 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PPN1	Q04119	674 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RTC1	Q08281	1341 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GSY1	P23337	708 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CKB2	P38930	258 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DSS1	P39112	969 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	QRI7	P43122	407 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YPR003C	P53394	754 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SND1	Q04007	877 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GSH2	Q08220	491 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RSA1	Q08932	381 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YLR125W	Q12138	136 aa		0.73	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PCK1	P10963	549 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PHO8	P11491	566 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CWH43	P25618	953 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YCR061W	P25639	631 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	PLC1	P32383	869 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	AGP2	P38090	596 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CIR1	P42940	261 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ESBP6	P53918	673 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YAT1	P80235	687 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YLR352W	Q06479	807 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DSS4	P32601	143 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	RKM3	P38222	552 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ARP1	P38696	384 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	ASG1	P40467	964 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	SAD1	P43589	448 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YPT11	P48559	417 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YNR071C	P53757	342 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	YNL058C	P53947	316 aa		0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
CSE1	YGL238W	CBP3	P21560	335 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	SEC65	P29478	273 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	ERC1	P38767	581 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	BUD16	P39988	312 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	YJL070C	P40361	888 aa		0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
CSE1	YGL238W	UBP16	Q02863	499 aa		0.71	□□□□□ -2.3

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