RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W GRX4P32642 244 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SPC29P33419 253 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SRL3P36167 246 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ATP3P38077 311 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W IFA38P38286 347 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SIP3P38717 1229 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PAC2P39937 518 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ATP22P50273 684 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W YGR266WP53326 701 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SPO1P53541 631 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W GIM3P53900 129 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W BET4Q00618 327 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W FDC1Q03034 503 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W MMR1Q06324 491 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W LOT6Q07923 191 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W ICL2Q12031 575 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W RRI2Q12348 645 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W SMC6Q12749 1114 aa3.59□□□□□ -1.83
VFA1YER128W INH1P01097 85 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ADH4P10127 382 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PET122P10355 254 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MSS116P15424 664 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PTP1P25044 335 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MRC1P25588 1096 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HCS1P34243 683 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CPR5P35176 225 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W EMC3P36039 253 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ECM4P36156 370 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SFB3P38810 929 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VID28P40547 921 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RLP7P40693 322 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SSN8P47821 323 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MDR1P53258 950 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DML1Q03652 475 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ATG16Q03818 150 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SPC19Q03954 165 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MGR3Q04472 501 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DYN3Q04949 312 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DON1Q05610 365 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W EAF1Q06337 982 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W OSW1Q08692 278 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YOL098CQ12496 1037 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MHP1P43638 1398 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SIN3P22579 1536 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W HSL1P34244 1518 aa3.58□□□□□ -1.84
VFA1YER128W JIP3O13555 125 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W REP1P03871 373 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W NMT1P14743 455 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MRPL8P22353 238 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VPS3P23643 1011 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CLB4P24871 460 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RPC19P28000 142 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ITR2P30606 609 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W KRE6P32486 720 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W VMA8P32610 256 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W XRS2P33301 854 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W BUD2P33314 1104 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W UBS1P38290 277 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CTM1P38818 585 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W DRS2P39524 1355 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W NUP60P39705 539 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YIL092WP40497 633 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SHR5P41912 237 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MRK1P50873 501 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MIG2P53035 382 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YBP2P53169 641 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ERP6P53198 216 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W YGR067CP53243 804 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ALG12P53730 551 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ALD6P54115 500 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RRN5Q02983 363 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ERO1Q03103 563 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TAF11Q04226 346 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ATG17Q06410 417 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W REH1Q06709 432 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TLG2Q08144 397 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W MET7Q08645 548 aa3.57□□□□□ -1.84
VFA1YER128W TAF2P23255 1407 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RAV1P47104 1357 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ILS1P09436 1072 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W CDC16P09798 840 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W RSR1P13856 272 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W GLK1P17709 500 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W EUG1P32474 517 aa3.56□□□□□ -1.84
VFA1YER128W SMI1P32566 505 aa3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 133.4 ms