RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	AIM14	P53109	570 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	MLC1	P53141	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VTC3	Q02725	835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ATG33	Q06485	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ATG23	Q06671	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RKI1	Q12189	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RAD51	P25454	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CAJ1	P39101	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	TAX4	P47030	604 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SFH1	Q06168	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	TMA16	Q08687	178 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PLP2	Q12017	286 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NCB2	Q92317	146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NUP1	P20676	1076 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	GSY1	P23337	708 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PCL2	P25693	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SPT8	P38915	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	BUD16	P39988	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	LTP1	P40347	161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SEC9	P40357	651 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VID28	P40547	921 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PMT6	P42934	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YJR039W	P47107	1121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	BOP3	P53958	396 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ABF1	P14164	731 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
POP4	YBR257W	YSW1	P38280	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	XBP1	P40489	647 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YJR008W	P47085	338 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YJR079W	P47126	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YJR142W	P47173	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NNF2	P53253	936 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VPS38	Q05919	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	STE23	Q06010	1027 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ULA1	Q12059	462 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RSF2	P46974	1380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	TPK2	P06245	380 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PMR1	P13586	950 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	TSR4	P25040	408 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	MSH2	P25847	964 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NFU1	P32860	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	HEL1	P36113	551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	MIC19	P43594	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	ARG7	Q04728	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	YFT2	Q06676	274 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	CIR2	Q08822	631 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RGT2	Q12300	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	POM34	Q12445	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RMP1	Q12530	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SAC3	P46674	1301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NUP133	P36161	1157 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	UBP12	P39538	1254 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NET1	P47035	1189 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	BIT61	P47041	543 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PIP2	P52960	996 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	PIB2	P53191	635 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	VAC14	Q06708	880 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	NTG2	Q08214	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	SDH5	Q08230	162 aa		4.84	□□□□□ -1.63
POP4	YBR257W	RAD1	P06777	1100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	APN1	P22936	367 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	PTP1	P25044	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	PEP3	P27801	918 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	SFP1	P32432	683 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	COS111	P38308	924 aa		4.83	□□□□□ -1.64
POP4	YBR257W	YHR202W	P38887	602 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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