RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519106.1

CLDN23-201, Transcript of claudin 23, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN23, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23-201ENST00000519106 CACNB3P54284 484 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PDE4BQ07343 736 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 FOCADQ5VW36 1801 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 TMEM87BQ96K49 555 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 MYH1P12882 1939 aa24.57■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 NFIAQ12857 509 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 TNIP1Q15025 636 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SENP2Q9HC62 589 aa24.55■■□□□ 1.52
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CLDN23-201ENST00000519106 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ECM29Q5VYK3 1845 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ORC4O43929 436 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 EVCP57679 992 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 GTF3C6Q969F1 213 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 LY9Q9HBG7 655 aa24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SCRN1Q12765 414 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SART3Q15020 963 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
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CLDN23-201ENST00000519106 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SMC3Q9UQE7 1217 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 FZD9O00144 591 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PFKFB2O60825 505 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 TCP10Q12799 353 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.53■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ERICH2A1L162 156 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 DLGAP5Q15398 846 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SPDYE2BA6NHP3 402 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 SPDYE6P0CI01 402 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
CLDN23-201ENST00000519106 PKP1Q13835 747 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.51■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 TSPY2A6NKD2 308 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 LIFRP42702 1097 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 WTAPQ15007 396 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 TTC6Q86TZ1 520 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 IQCA1Q86XH1 822 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 IDI2Q9BXS1 227 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 TNKSO95271 1327 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 SHTN1A0MZ66 631 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 LMNB1P20700 586 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.5■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 GJB2P29033 226 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 CDK8P49336 464 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 MTA3Q9BTC8 594 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 CCDC69A6NI79 296 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 NMT2O60551 498 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 TFAP4Q01664 338 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.49■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 CLRN2A0PK11 232 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 APOA5Q6Q788 366 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.48■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 RXRAP19793 462 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 SEC23AQ15436 765 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 MYL10Q9BUA6 226 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
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CLDN23-201ENST00000519106 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 JAK2O60674 1132 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 RASA1P20936 1047 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 NUCB2P80303 420 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 TMTC2Q8N394 836 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.46■■□□□ 1.51
CLDN23-201ENST00000519106 HLA-DOAP06340 250 aa24.46■■□□□ 1.51
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