RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 MNS1Q8NEH6 495 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC14Q96N46 770 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MRIQ9BWK5 157 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MYH1P12882 1939 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 USP17L3A6NCW0 530 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 USP17L4A6NCW7 530 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GSG1L2A8MUP6 293 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 IRF6O14896 467 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CASTP20810 708 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 AOC3Q16853 763 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 USP17L1Q7RTZ2 530 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MIGA1Q8NAN2 632 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NAPBQ9H115 298 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF213O14771 459 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS6KB1P23443 525 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DACT2Q5SW24 774 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NEK1Q96PY6 1258 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DBNDD1Q9H9R9 158 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RSPH14Q9UHP6 348 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ANAPC4Q9UJX5 808 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 JAG2Q9Y219 1238 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 E7EWF7 191 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NT5C2P49902 561 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SEMA3FQ13275 785 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD1Q15327 319 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GRIK5Q16478 980 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ADCK5Q3MIX3 580 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TAOK3Q9H2K8 898 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 COL4A5P29400 1685 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PCP11498 1178 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TDO2P48775 406 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SBK1Q52WX2 424 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXL16Q8N461 479 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CERS5Q8N5B7 392 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SBF1O95248 1867 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 STOX1Q6ZVD7 989 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NIM1KQ8IY84 436 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NCOA7Q8NI08 942 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 FBXW7Q969H0 707 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MYH8P13535 1937 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 YDJCA8MPS7 323 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PRKAB2O43741 272 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DSG3P32926 999 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DDIT3P35638 169 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 BTDP43251 543 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHL40Q2TBA0 621 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 IFFO2Q5TF58 517 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TEKT1Q969V4 418 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MTA3Q9BTC8 594 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNRF3Q9ULT6 936 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 BCS1LQ9Y276 419 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.4□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 NFKBIEO00221 500 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 AK2P54819 239 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 TRDNQ13061 729 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 CUL4AQ13619 759 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 NLGN2Q8NFZ4 835 aa8.4□□□□□ -1.07
SMARCE1-211ENST00000493660 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.4□□□□□ -1.07
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