RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cfc1P97766 202 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stxbp6Q8R3T5 210 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc71lE9Q4T4 218 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf9P20334 256 aa9.67□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5089A1L3C8 106 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf185Q91YT2 192 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ufc1Q9CR09 167 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dusp14Q9JLY7 198 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defa34D3Z0J0 93 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01748 117 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps20P60867 119 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AhspQ9CY02 102 aa9.66□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igfn1Q3KNY0 2849 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim15Q3UTD9 74 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr810Q8VFH9 312 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasl11bQ922H7 247 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnn3Q9DAW9 330 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Erg28Q9ERY9 140 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde6hP61249 83 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2tQ9CQ37 204 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spcs1Q9D958 161 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb8Q9JK92 196 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26920S4R2A5 56 aa9.65□□□□□ -0.86
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6525A0A0A6YW33 106 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9242J3QNY1 357 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc16a4Q8R0M8 500 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufc2Q9CQ54 120 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspg2Q05793 3707 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700056E22RikF7CNM6 234 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01794 123 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SbpP15501 199 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5150Q1AN92 299 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem136Q3TYE7 245 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Samd10Q7TST3 202 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ociad2Q9D8W7 154 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tenm4Q3UHK6 2771 aa9.64□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Amn1B8JKV0 258 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr3O09116 238 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cited2O35740 269 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpx1P11352 201 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vsig8Q6P3A4 417 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map1lc3aQ91VR7 121 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CX63 252 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm33815A0A087WNV3 176 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29644A0A087WPG2 191 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26602M0QWA4 95 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ebi3O35228 228 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf6P21658 208 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr322Q5NCC8 327 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr317Q5NCD6 327 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MycbQ6P8Z1 170 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Odf3l1Q810P2 275 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lypd1Q8BLC3 141 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9961Q8BNV2 113 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc15bQ9JHY4 80 aa9.63□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav14-2A0A075B694 121 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29289A0A087WPY7 166 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4064A0A087WR82 380 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2al2bA9Z055 111 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10352B2RWR6 380 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vsig4F6TUL9 280 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21693J3QK27 380 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbmy1a1O35698 380 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav2Q5R1I9 109 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr1dQ61224 374 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MsmbO08540 113 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gp9O88186 177 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-DMb1P35737 261 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv4-81A0A0G2JEY5 119 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1520401A03RikA0A0J9YVH6 598 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20517G3UVU6 152 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5294J3QP53 216 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm12888Q3UW77 119 aa9.62□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-77A0A0G2JGS9 117 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01801 115 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a8P27005 89 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spink10Q8CAC8 162 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr498Q8VEW2 330 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 8030423J24RikQ9CX45 142 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-22A0A075B5U7 117 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav16d-dv11A0A075B617 117 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BatfO35284 125 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TcraP01849 138 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D727 114 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arl3Q9WUL7 182 aa9.61□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3250E9Q1M3 230 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spock3Q8BKV0 436 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10118Q8C8J5 116 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtf2h5Q8K2X8 71 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CrygbP04344 175 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tcl1b4P56844 120 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Khdc1aQ3UWR2 166 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fmc1Q9CR13 113 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtsf1lQ9CWD0 151 aa9.6□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P06330 118 aa9.59□□□□□ -0.87
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl26Q9DCS2 204 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.1 ms