RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.47□□□□□ -1.85
TTLL3-232ENST00000496526 MT3P25713 68 aa3.46□□□□□ -1.85
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.43□□□□□ -1.86
TTLL3-232ENST00000496526 MT4P47944 62 aa3.4□□□□□ -1.87
TTLL3-232ENST00000496526 RNF213Q63HN8 5207 aa3.38□□□□□ -1.87
TTLL3-232ENST00000496526 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.35□□□□□ -1.87
TTLL3-232ENST00000496526 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.35□□□□□ -1.87
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.31□□□□□ -1.88
TTLL3-232ENST00000496526 MT1AP04731 61 aa3.28□□□□□ -1.88
TTLL3-232ENST00000496526 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.28□□□□□ -1.88
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.28□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.26□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.26□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.25□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.23□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1DQ5T752 114 aa3.22□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.21□□□□□ -1.89
TTLL3-232ENST00000496526 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.2□□□□□ -1.9
TTLL3-232ENST00000496526 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.18□□□□□ -1.9
TTLL3-232ENST00000496526 PRM1P04553 51 aa3.16□□□□□ -1.9
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.16□□□□□ -1.9
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.16□□□□□ -1.9
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.14□□□□□ -1.91
TTLL3-232ENST00000496526 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
TTLL3-232ENST00000496526 MUC2Q02817 5179 aa3.13□□□□□ -1.91
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
TTLL3-232ENST00000496526 LCE4AQ5TA78 99 aa3.1□□□□□ -1.91
TTLL3-232ENST00000496526 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.07□□□□□ -1.92
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.06□□□□□ -1.92
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.01□□□□□ -1.93
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3□□□□□ -1.93
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.99□□□□□ -1.93
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.98□□□□□ -1.93
TTLL3-232ENST00000496526 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.95□□□□□ -1.94
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.9□□□□□ -1.95
TTLL3-232ENST00000496526 USH2AO75445 5202 aa2.77□□□□□ -1.97
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-9P26371 169 aa2.75□□□□□ -1.97
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1CQ5T751 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1EQ5T753 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TTLL3-232ENST00000496526 LCE1FQ5T754 118 aa2.75□□□□□ -1.97
TTLL3-232ENST00000496526 NEBP20929 6669 aa2.7□□□□□ -1.98
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.68□□□□□ -1.98
TTLL3-232ENST00000496526 KMT2DO14686 5537 aa2.64□□□□□ -1.99
TTLL3-232ENST00000496526 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
TTLL3-232ENST00000496526 SSPOA2VEC9 5147 aa2.63□□□□□ -1.99
TTLL3-232ENST00000496526 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TTLL3-232ENST00000496526 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.55□□□□□ -2
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.52□□□□□ -2.01
TTLL3-232ENST00000496526 MDN1Q9NU22 5596 aa2.47□□□□□ -2.01
TTLL3-232ENST00000496526 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.45□□□□□ -2.02
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.41□□□□□ -2.02
TTLL3-232ENST00000496526 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.37□□□□□ -2.03
TTLL3-232ENST00000496526 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.33□□□□□ -2.04
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.3□□□□□ -2.04
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.19□□□□□ -2.06
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.19□□□□□ -2.06
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.17□□□□□ -2.06
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.11□□□□□ -2.07
TTLL3-232ENST00000496526 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.08□□□□□ -2.08
TTLL3-232ENST00000496526 MUC5ACP98088 5654 aa2.01□□□□□ -2.09
TTLL3-232ENST00000496526 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.95□□□□□ -2.1
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-8O75690 187 aa1.9□□□□□ -2.1
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.87□□□□□ -2.11
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.77□□□□□ -2.13
TTLL3-232ENST00000496526 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
TTLL3-232ENST00000496526 PHGR1C9JFL3 82 aa1.72□□□□□ -2.13
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.7□□□□□ -2.14
TTLL3-232ENST00000496526 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.62□□□□□ -2.15
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.55□□□□□ -2.16
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.53□□□□□ -2.16
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.35□□□□□ -2.19
TTLL3-232ENST00000496526 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.01□□□□□ -2.25
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