RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480357.5

SCLY-215, Transcript of selenocysteine lyase, human

TSL 1 (best)

Gene SCLY, Length 5,668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCLY-215	ENST00000480357	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SCLY-215	ENST00000480357	MT1E	P04732	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SCLY-215	ENST00000480357	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	MUC2	Q02817	5179 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SCLY-215	ENST00000480357	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCLY-215	ENST00000480357	MT1M	Q8N339	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCLY-215	ENST00000480357	MT4	P47944	62 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SCLY-215	ENST00000480357	MT3	P25713	68 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SCLY-215	ENST00000480357	PRM1	P04553	51 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.45	□□□□□ -1.7
SCLY-215	ENST00000480357	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SCLY-215	ENST00000480357	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SCLY-215	ENST00000480357	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.31	□□□□□ -1.72
SCLY-215	ENST00000480357	MT1A	P04731	61 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SCLY-215	ENST00000480357	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SCLY-215	ENST00000480357	USH2A	O75445	5202 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SCLY-215	ENST00000480357	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SCLY-215	ENST00000480357	KMT2D	O14686	5537 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SCLY-215	ENST00000480357	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.94	□□□□□ -1.78
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.9	□□□□□ -1.79
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.83	□□□□□ -1.8
SCLY-215	ENST00000480357	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SCLY-215	ENST00000480357	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.74	□□□□□ -1.81
SCLY-215	ENST00000480357	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.73	□□□□□ -1.81
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SCLY-215	ENST00000480357	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SCLY-215	ENST00000480357	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.69	□□□□□ -1.82
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.68	□□□□□ -1.82
SCLY-215	ENST00000480357	NEB	P20929	6669 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SCLY-215	ENST00000480357	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.4	□□□□□ -1.86
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SCLY-215	ENST00000480357	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.02	□□□□□ -1.93
SCLY-215	ENST00000480357	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3	□□□□□ -1.93
SCLY-215	ENST00000480357	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.45	□□□□□ -2.02
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.39	□□□□□ -2.03
SCLY-215	ENST00000480357	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.34	□□□□□ -2.04
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.33	□□□□□ -2.04
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.27	□□□□□ -2.05
SCLY-215	ENST00000480357	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.26	□□□□□ -2.05
SCLY-215	ENST00000480357	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.21	□□□□□ -2.06
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.14	□□□□□ -2.07
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.11	□□□□□ -2.07
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.02	□□□□□ -2.09
SCLY-215	ENST00000480357	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.85	□□□□□ -2.11
SCLY-215	ENST00000480357	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.36	□□□□□ -2.19

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