RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430930.5

TNS1-207, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-207ENST00000430930 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.9□□□□□ -1.78
TNS1-207ENST00000430930 MT1AP04731 61 aa3.87□□□□□ -1.79
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.84□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.82□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.82□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 LCE1DQ5T752 114 aa3.81□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.78□□□□□ -1.8
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.76□□□□□ -1.81
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.76□□□□□ -1.81
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.76□□□□□ -1.81
TNS1-207ENST00000430930 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.68□□□□□ -1.82
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.67□□□□□ -1.82
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.61□□□□□ -1.83
TNS1-207ENST00000430930 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.61□□□□□ -1.83
TNS1-207ENST00000430930 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.59□□□□□ -1.83
TNS1-207ENST00000430930 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.59□□□□□ -1.83
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.59□□□□□ -1.84
TNS1-207ENST00000430930 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.57□□□□□ -1.84
TNS1-207ENST00000430930 LCE4AQ5TA78 99 aa3.56□□□□□ -1.84
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.53□□□□□ -1.84
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.52□□□□□ -1.85
TNS1-207ENST00000430930 RNF213Q63HN8 5207 aa3.52□□□□□ -1.85
TNS1-207ENST00000430930 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.51□□□□□ -1.85
TNS1-207ENST00000430930 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.51□□□□□ -1.85
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.5□□□□□ -1.85
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.43□□□□□ -1.86
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.41□□□□□ -1.86
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
TNS1-207ENST00000430930 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.37□□□□□ -1.87
TNS1-207ENST00000430930 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
TNS1-207ENST00000430930 LCE1CQ5T751 118 aa3.29□□□□□ -1.88
TNS1-207ENST00000430930 LCE1EQ5T753 118 aa3.29□□□□□ -1.88
TNS1-207ENST00000430930 LCE1FQ5T754 118 aa3.29□□□□□ -1.88
TNS1-207ENST00000430930 MUC2Q02817 5179 aa3.16□□□□□ -1.9
TNS1-207ENST00000430930 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.09□□□□□ -1.91
TNS1-207ENST00000430930 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.04□□□□□ -1.92
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-9P26371 169 aa3.03□□□□□ -1.93
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.89□□□□□ -1.95
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.84□□□□□ -1.95
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.84□□□□□ -1.95
TNS1-207ENST00000430930 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
TNS1-207ENST00000430930 NEBP20929 6669 aa2.81□□□□□ -1.96
TNS1-207ENST00000430930 USH2AO75445 5202 aa2.79□□□□□ -1.96
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.76□□□□□ -1.97
TNS1-207ENST00000430930 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
TNS1-207ENST00000430930 SSPOA2VEC9 5147 aa2.74□□□□□ -1.97
TNS1-207ENST00000430930 KMT2DO14686 5537 aa2.74□□□□□ -1.97
TNS1-207ENST00000430930 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
TNS1-207ENST00000430930 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.61□□□□□ -1.99
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -2
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.58□□□□□ -2
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.55□□□□□ -2
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.55□□□□□ -2
TNS1-207ENST00000430930 MDN1Q9NU22 5596 aa2.5□□□□□ -2.01
TNS1-207ENST00000430930 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.41□□□□□ -2.02
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.38□□□□□ -2.03
TNS1-207ENST00000430930 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.25□□□□□ -2.05
TNS1-207ENST00000430930 MUC5ACP98088 5654 aa2.12□□□□□ -2.07
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.1□□□□□ -2.07
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.09□□□□□ -2.08
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-8O75690 187 aa2.09□□□□□ -2.08
TNS1-207ENST00000430930 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.02□□□□□ -2.09
TNS1-207ENST00000430930 PHGR1C9JFL3 82 aa1.96□□□□□ -2.1
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.93□□□□□ -2.1
TNS1-207ENST00000430930 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
TNS1-207ENST00000430930 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.88□□□□□ -2.11
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.85□□□□□ -2.11
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.77□□□□□ -2.13
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.71□□□□□ -2.14
TNS1-207ENST00000430930 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.68□□□□□ -2.14
TNS1-207ENST00000430930 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.55□□□□□ -2.16
TNS1-207ENST00000430930 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms