RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 LCE2BO14633 110 aa2.99□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.98□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 MT3P25713 68 aa2.97□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 MT1MQ8N339 61 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 MUC2Q02817 5179 aa2.95□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2DP22532 72 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.93□□□□□ -1.94
HERC3-202ENST00000402738 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.89□□□□□ -1.95
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-202ENST00000402738 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.82□□□□□ -1.96
HERC3-202ENST00000402738 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-202ENST00000402738 MT1AP04731 61 aa2.75□□□□□ -1.97
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.73□□□□□ -1.97
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.73□□□□□ -1.97
HERC3-202ENST00000402738 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.73□□□□□ -1.97
HERC3-202ENST00000402738 LCE1DQ5T752 114 aa2.7□□□□□ -1.98
HERC3-202ENST00000402738 MT4P47944 62 aa2.67□□□□□ -1.98
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC3-202ENST00000402738 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HERC3-202ENST00000402738 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.59□□□□□ -1.99
HERC3-202ENST00000402738 USH2AO75445 5202 aa2.59□□□□□ -1.99
HERC3-202ENST00000402738 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
HERC3-202ENST00000402738 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.53□□□□□ -2
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-202ENST00000402738 KMT2DO14686 5537 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.51□□□□□ -2.01
HERC3-202ENST00000402738 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.46□□□□□ -2.02
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.43□□□□□ -2.02
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.42□□□□□ -2.02
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-9P26371 169 aa2.4□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 SSPOA2VEC9 5147 aa2.39□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 LCE1CQ5T751 118 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 LCE1EQ5T753 118 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 LCE1FQ5T754 118 aa2.38□□□□□ -2.03
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.31□□□□□ -2.04
HERC3-202ENST00000402738 LCE4AQ5TA78 99 aa2.3□□□□□ -2.04
HERC3-202ENST00000402738 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.28□□□□□ -2.04
HERC3-202ENST00000402738 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
HERC3-202ENST00000402738 NEBP20929 6669 aa2.22□□□□□ -2.05
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.05
HERC3-202ENST00000402738 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.1□□□□□ -2.07
HERC3-202ENST00000402738 MDN1Q9NU22 5596 aa2.03□□□□□ -2.08
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2□□□□□ -2.09
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa1.98□□□□□ -2.09
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.96□□□□□ -2.1
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.95□□□□□ -2.1
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.95□□□□□ -2.1
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.84□□□□□ -2.11
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.84□□□□□ -2.11
HERC3-202ENST00000402738 MUC5ACP98088 5654 aa1.77□□□□□ -2.13
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.7□□□□□ -2.14
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.7□□□□□ -2.14
HERC3-202ENST00000402738 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.69□□□□□ -2.14
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.67□□□□□ -2.14
HERC3-202ENST00000402738 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.6□□□□□ -2.15
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-8O75690 187 aa1.55□□□□□ -2.16
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.52□□□□□ -2.17
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.47□□□□□ -2.17
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.41□□□□□ -2.18
HERC3-202ENST00000402738 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
HERC3-202ENST00000402738 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.35□□□□□ -2.19
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.35□□□□□ -2.19
HERC3-202ENST00000402738 PHGR1C9JFL3 82 aa1.26□□□□□ -2.21
HERC3-202ENST00000402738 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.83□□□□□ -2.28
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