RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MT1EP04732 61 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-202ENST00000400053 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRM-202ENST00000400053 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRM-202ENST00000400053 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRM-202ENST00000400053 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 PRM1P04553 51 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 MT1MQ8N339 61 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1DQ5T752 114 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 MT4P47944 62 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-202ENST00000400053 USH2AO75445 5202 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-202ENST00000400053 MT1AP04731 61 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-202ENST00000400053 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-202ENST00000400053 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRM-202ENST00000400053 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-202ENST00000400053 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRM-202ENST00000400053 KMT2DO14686 5537 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 LCE4AQ5TA78 99 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1CQ5T751 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1EQ5T753 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 LCE1FQ5T754 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRM-202ENST00000400053 SSPOA2VEC9 5147 aa2.3□□□□□ -2.04
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-202ENST00000400053 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-9P26371 169 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.12□□□□□ -2.07
PTPRM-202ENST00000400053 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.1□□□□□ -2.07
PTPRM-202ENST00000400053 MDN1Q9NU22 5596 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa1.97□□□□□ -2.09
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.96□□□□□ -2.1
PTPRM-202ENST00000400053 NEBP20929 6669 aa1.91□□□□□ -2.1
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.83□□□□□ -2.12
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.82□□□□□ -2.12
PTPRM-202ENST00000400053 MUC5ACP98088 5654 aa1.77□□□□□ -2.13
PTPRM-202ENST00000400053 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.74□□□□□ -2.13
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.74□□□□□ -2.13
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.74□□□□□ -2.13
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.61□□□□□ -2.15
PTPRM-202ENST00000400053 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.59□□□□□ -2.15
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.54□□□□□ -2.16
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-8O75690 187 aa1.44□□□□□ -2.18
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.39□□□□□ -2.19
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.36□□□□□ -2.19
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.35□□□□□ -2.19
PTPRM-202ENST00000400053 PHGR1C9JFL3 82 aa1.34□□□□□ -2.2
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
PTPRM-202ENST00000400053 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
PTPRM-202ENST00000400053 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.23□□□□□ -2.21
PTPRM-202ENST00000400053 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.22□□□□□ -2.21
PTPRM-202ENST00000400053 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
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