RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC2Q02817 5179 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP4-202ENST00000392011 MT1MQ8N339 61 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.44□□□□□ -1.54
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
SH3BP4-202ENST00000392011 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4-202ENST00000392011 MT3P25713 68 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-202ENST00000392011 MT4P47944 62 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4-202ENST00000392011 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SH3BP4-202ENST00000392011 PRM1P04553 51 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-202ENST00000392011 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.04□□□□□ -1.6
SH3BP4-202ENST00000392011 MT1AP04731 61 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4-202ENST00000392011 USH2AO75445 5202 aa4.95□□□□□ -1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1DQ5T752 114 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.88□□□□□ -1.63
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.8□□□□□ -1.64
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.78□□□□□ -1.64
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.76□□□□□ -1.65
SH3BP4-202ENST00000392011 KMT2DO14686 5537 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4-202ENST00000392011 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.68□□□□□ -1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE4AQ5TA78 99 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.38□□□□□ -1.71
SH3BP4-202ENST00000392011 SSPOA2VEC9 5147 aa4.35□□□□□ -1.71
SH3BP4-202ENST00000392011 MDN1Q9NU22 5596 aa4.33□□□□□ -1.72
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP4-202ENST00000392011 NEBP20929 6669 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-9P26371 169 aa4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1CQ5T751 118 aa4.08□□□□□ -1.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1EQ5T753 118 aa4.08□□□□□ -1.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE1FQ5T754 118 aa4.08□□□□□ -1.76
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.02□□□□□ -1.77
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP4-202ENST00000392011 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC5ACP98088 5654 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.51□□□□□ -1.85
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP4-202ENST00000392011 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.47□□□□□ -1.85
SH3BP4-202ENST00000392011 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.15□□□□□ -1.9
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-8O75690 187 aa2.93□□□□□ -1.94
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.9□□□□□ -1.94
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.89□□□□□ -1.95
SH3BP4-202ENST00000392011 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.58□□□□□ -2
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.55□□□□□ -2
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.51□□□□□ -2.01
SH3BP4-202ENST00000392011 PHGR1C9JFL3 82 aa2.46□□□□□ -2.02
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.05
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.19□□□□□ -2.06
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4-202ENST00000392011 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.55□□□□□ -2.16
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