RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 RNF213Q63HN8 5207 aa6.61□□□□□ -1.35
CNNM4-201ENST00000377075 SPRR2DP22532 72 aa6.55□□□□□ -1.36
CNNM4-201ENST00000377075 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.53□□□□□ -1.36
CNNM4-201ENST00000377075 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.47□□□□□ -1.37
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.46□□□□□ -1.38
CNNM4-201ENST00000377075 MT1MQ8N339 61 aa6.43□□□□□ -1.38
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.39□□□□□ -1.39
CNNM4-201ENST00000377075 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.37□□□□□ -1.39
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.31□□□□□ -1.4
CNNM4-201ENST00000377075 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CNNM4-201ENST00000377075 PRM1P04553 51 aa6.13□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.12□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.12□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.12□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.11□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.07□□□□□ -1.44
CNNM4-201ENST00000377075 MT3P25713 68 aa6.07□□□□□ -1.44
CNNM4-201ENST00000377075 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
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CNNM4-201ENST00000377075 MT4P47944 62 aa5.92□□□□□ -1.46
CNNM4-201ENST00000377075 MT1AP04731 61 aa5.92□□□□□ -1.46
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.9□□□□□ -1.46
CNNM4-201ENST00000377075 USH2AO75445 5202 aa5.9□□□□□ -1.47
CNNM4-201ENST00000377075 KMT2DO14686 5537 aa5.78□□□□□ -1.48
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CNNM4-201ENST00000377075 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.73□□□□□ -1.49
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CNNM4-201ENST00000377075 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.65□□□□□ -1.5
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CNNM4-201ENST00000377075 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.47□□□□□ -1.53
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.45□□□□□ -1.54
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CNNM4-201ENST00000377075 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.34□□□□□ -1.55
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.25□□□□□ -1.57
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CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CNNM4-201ENST00000377075 MUC19Q7Z5P9 8384 aa5.06□□□□□ -1.6
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.03□□□□□ -1.6
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CNNM4-201ENST00000377075 MDN1Q9NU22 5596 aa4.99□□□□□ -1.61
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.9□□□□□ -1.62
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-9P26371 169 aa4.78□□□□□ -1.64
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.69□□□□□ -1.66
CNNM4-201ENST00000377075 NEBP20929 6669 aa4.66□□□□□ -1.66
CNNM4-201ENST00000377075 LCE1CQ5T751 118 aa4.63□□□□□ -1.67
CNNM4-201ENST00000377075 LCE1EQ5T753 118 aa4.63□□□□□ -1.67
CNNM4-201ENST00000377075 LCE1FQ5T754 118 aa4.63□□□□□ -1.67
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.59□□□□□ -1.67
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.51□□□□□ -1.69
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.22□□□□□ -1.73
CNNM4-201ENST00000377075 MUC5ACP98088 5654 aa4.2□□□□□ -1.74
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.19□□□□□ -1.74
CNNM4-201ENST00000377075 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.15□□□□□ -1.75
CNNM4-201ENST00000377075 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.06□□□□□ -1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.04□□□□□ -1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.04□□□□□ -1.76
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.04□□□□□ -1.76
CNNM4-201ENST00000377075 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.68□□□□□ -1.82
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.55□□□□□ -1.84
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.55□□□□□ -1.84
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.44□□□□□ -1.86
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-8O75690 187 aa3.35□□□□□ -1.87
CNNM4-201ENST00000377075 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.09□□□□□ -1.91
CNNM4-201ENST00000377075 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.04□□□□□ -1.92
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3□□□□□ -1.93
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.76□□□□□ -1.97
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
CNNM4-201ENST00000377075 PHGR1C9JFL3 82 aa2.71□□□□□ -1.98
CNNM4-201ENST00000377075 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.42□□□□□ -2.02
CNNM4-201ENST00000377075 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.79□□□□□ -2.12
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