RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.23□□□□□ -1.57
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1MQ8N339 61 aa5.21□□□□□ -1.58
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF213Q63HN8 5207 aa5.19□□□□□ -1.58
SH3BP4-201ENST00000344528 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.18□□□□□ -1.58
SH3BP4-201ENST00000344528 MT3P25713 68 aa5.07□□□□□ -1.6
SH3BP4-201ENST00000344528 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.06□□□□□ -1.6
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.01□□□□□ -1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.99□□□□□ -1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 MT4P47944 62 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.96□□□□□ -1.62
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.94□□□□□ -1.62
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC2Q02817 5179 aa4.9□□□□□ -1.63
SH3BP4-201ENST00000344528 MT1AP04731 61 aa4.85□□□□□ -1.63
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.79□□□□□ -1.64
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1DQ5T752 114 aa4.72□□□□□ -1.65
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 PRM1P04553 51 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.69□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.65□□□□□ -1.66
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE4AQ5TA78 99 aa4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP4-201ENST00000344528 USH2AO75445 5202 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP4-201ENST00000344528 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4-201ENST00000344528 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4-201ENST00000344528 KMT2DO14686 5537 aa4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-9P26371 169 aa4.1□□□□□ -1.75
SH3BP4-201ENST00000344528 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4-201ENST00000344528 NEBP20929 6669 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1CQ5T751 118 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1EQ5T753 118 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4-201ENST00000344528 LCE1FQ5T754 118 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4-201ENST00000344528 SSPOA2VEC9 5147 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4-201ENST00000344528 MDN1Q9NU22 5596 aa3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.83□□□□□ -1.8
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP4-201ENST00000344528 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.24□□□□□ -1.89
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC5ACP98088 5654 aa3.17□□□□□ -1.9
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.12□□□□□ -1.91
SH3BP4-201ENST00000344528 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.09□□□□□ -1.92
SH3BP4-201ENST00000344528 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-8O75690 187 aa2.84□□□□□ -1.95
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.83□□□□□ -1.96
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.7□□□□□ -1.98
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SH3BP4-201ENST00000344528 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.53□□□□□ -2
SH3BP4-201ENST00000344528 PHGR1C9JFL3 82 aa2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.47□□□□□ -2.01
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.34□□□□□ -2.03
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4-201ENST00000344528 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.01□□□□□ -2.09
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.5□□□□□ -2.17
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