RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311160.13

TNS3-201, Transcript of tensin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS3, Length 7,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.31□□□□□ -1.88
TNS3-201ENST00000311160 LRP2P98164 4655 aa3.3□□□□□ -1.88
TNS3-201ENST00000311160 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.29□□□□□ -1.88
TNS3-201ENST00000311160 LPAP08519 4548 aa3.28□□□□□ -1.88
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.25□□□□□ -1.89
TNS3-201ENST00000311160 TNXBP22105 4242 aa3.23□□□□□ -1.89
TNS3-201ENST00000311160 MT1BP07438 61 aa3.22□□□□□ -1.89
TNS3-201ENST00000311160 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.22□□□□□ -1.89
TNS3-201ENST00000311160 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
TNS3-201ENST00000311160 MT1LQ93083 61 aa3.21□□□□□ -1.9
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.2□□□□□ -1.9
TNS3-201ENST00000311160 MUC17Q685J3 4493 aa3.18□□□□□ -1.9
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.18□□□□□ -1.9
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.14□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.12□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.11□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.11□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.11□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.09□□□□□ -1.91
TNS3-201ENST00000311160 MT1EP04732 61 aa3.08□□□□□ -1.92
TNS3-201ENST00000311160 MT1MQ8N339 61 aa3.07□□□□□ -1.92
TNS3-201ENST00000311160 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
TNS3-201ENST00000311160 USH2AO75445 5202 aa2.97□□□□□ -1.93
TNS3-201ENST00000311160 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.95□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.93□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 MUC2Q02817 5179 aa2.91□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.91□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.91□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.91□□□□□ -1.94
TNS3-201ENST00000311160 SSPOA2VEC9 5147 aa2.88□□□□□ -1.95
TNS3-201ENST00000311160 MT1AP04731 61 aa2.85□□□□□ -1.95
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.84□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.82□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.82□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.78□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.78□□□□□ -1.96
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.73□□□□□ -1.97
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.69□□□□□ -1.98
TNS3-201ENST00000311160 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.68□□□□□ -1.98
TNS3-201ENST00000311160 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.65□□□□□ -1.99
TNS3-201ENST00000311160 NEBP20929 6669 aa2.64□□□□□ -1.99
TNS3-201ENST00000311160 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.52□□□□□ -2.01
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.47□□□□□ -2.01
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-9P26371 169 aa2.46□□□□□ -2.01
TNS3-201ENST00000311160 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.46□□□□□ -2.02
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS3-201ENST00000311160 KMT2DO14686 5537 aa2.45□□□□□ -2.02
TNS3-201ENST00000311160 MDN1Q9NU22 5596 aa2.4□□□□□ -2.02
TNS3-201ENST00000311160 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.39□□□□□ -2.03
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.32□□□□□ -2.04
TNS3-201ENST00000311160 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.3□□□□□ -2.04
TNS3-201ENST00000311160 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
TNS3-201ENST00000311160 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.22□□□□□ -2.05
TNS3-201ENST00000311160 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.05□□□□□ -2.08
TNS3-201ENST00000311160 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.01□□□□□ -2.09
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.99□□□□□ -2.09
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
TNS3-201ENST00000311160 PHGR1C9JFL3 82 aa1.91□□□□□ -2.1
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.88□□□□□ -2.11
TNS3-201ENST00000311160 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.77□□□□□ -2.13
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.74□□□□□ -2.13
TNS3-201ENST00000311160 MUC5ACP98088 5654 aa1.71□□□□□ -2.13
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.69□□□□□ -2.14
TNS3-201ENST00000311160 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.68□□□□□ -2.14
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-8O75690 187 aa1.67□□□□□ -2.14
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.51□□□□□ -2.17
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.42□□□□□ -2.18
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.3□□□□□ -2.2
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
TNS3-201ENST00000311160 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.17□□□□□ -2.22
TNS3-201ENST00000311160 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms