RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.2□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 MT1MQ8N339 61 aa5.17□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.16□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 RNF213Q63HN8 5207 aa5.16□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 MT3P25713 68 aa5.15□□□□□ -1.58
LRRC3-201ENST00000291592 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.15□□□□□ -1.59
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.11□□□□□ -1.59
LRRC3-201ENST00000291592 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.08□□□□□ -1.6
LRRC3-201ENST00000291592 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.06□□□□□ -1.6
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.06□□□□□ -1.6
LRRC3-201ENST00000291592 MT4P47944 62 aa5.02□□□□□ -1.61
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.02□□□□□ -1.61
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.01□□□□□ -1.61
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1DQ5T752 114 aa4.97□□□□□ -1.61
LRRC3-201ENST00000291592 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.83□□□□□ -1.64
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.8□□□□□ -1.64
LRRC3-201ENST00000291592 MUC2Q02817 5179 aa4.79□□□□□ -1.64
LRRC3-201ENST00000291592 MT1AP04731 61 aa4.76□□□□□ -1.65
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.72□□□□□ -1.65
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.71□□□□□ -1.66
LRRC3-201ENST00000291592 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRC3-201ENST00000291592 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.67□□□□□ -1.66
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.62□□□□□ -1.67
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.52□□□□□ -1.69
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.51□□□□□ -1.69
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.42□□□□□ -1.7
LRRC3-201ENST00000291592 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.42□□□□□ -1.7
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.38□□□□□ -1.71
LRRC3-201ENST00000291592 USH2AO75445 5202 aa4.35□□□□□ -1.71
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1CQ5T751 118 aa4.33□□□□□ -1.72
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1EQ5T753 118 aa4.33□□□□□ -1.72
LRRC3-201ENST00000291592 LCE1FQ5T754 118 aa4.33□□□□□ -1.72
LRRC3-201ENST00000291592 LCE4AQ5TA78 99 aa4.33□□□□□ -1.72
LRRC3-201ENST00000291592 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
LRRC3-201ENST00000291592 KMT2DO14686 5537 aa4.18□□□□□ -1.74
LRRC3-201ENST00000291592 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
LRRC3-201ENST00000291592 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-9P26371 169 aa4.03□□□□□ -1.76
LRRC3-201ENST00000291592 SSPOA2VEC9 5147 aa4□□□□□ -1.77
LRRC3-201ENST00000291592 NEBP20929 6669 aa3.98□□□□□ -1.77
LRRC3-201ENST00000291592 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.85□□□□□ -1.79
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.83□□□□□ -1.8
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.8□□□□□ -1.8
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.73□□□□□ -1.81
LRRC3-201ENST00000291592 MDN1Q9NU22 5596 aa3.69□□□□□ -1.82
LRRC3-201ENST00000291592 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.66□□□□□ -1.82
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRC3-201ENST00000291592 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.46□□□□□ -1.86
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.34□□□□□ -1.88
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.13□□□□□ -1.91
LRRC3-201ENST00000291592 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.93
LRRC3-201ENST00000291592 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.9□□□□□ -1.94
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-8O75690 187 aa2.86□□□□□ -1.95
LRRC3-201ENST00000291592 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.84□□□□□ -1.95
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.83□□□□□ -1.96
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.72□□□□□ -1.97
LRRC3-201ENST00000291592 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
LRRC3-201ENST00000291592 PHGR1C9JFL3 82 aa2.49□□□□□ -2.01
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.48□□□□□ -2.01
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.46□□□□□ -2.02
LRRC3-201ENST00000291592 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.38□□□□□ -2.03
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.2□□□□□ -2.06
LRRC3-201ENST00000291592 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.18□□□□□ -2.06
LRRC3-201ENST00000291592 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.46□□□□□ -2.18
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