RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	IGKV2-30	P06310	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFS5	O43920	106 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193		Q5VSD8	79 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RDM1-223	ENST00000619193	FAT1	Q14517	4588 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193		A6NED7	52 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.32	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00313	P59037	77 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	SEC61G	P60059	68 aa		3.31	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	ACYP2	P14621	99 aa		3.3	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		3.29	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		3.28	□□□□□ -1.88
RDM1-223	ENST00000619193	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	MUC2	Q02817	5179 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		3.25	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	LRP2	P98164	4655 aa		3.24	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193		A8MUU9	505 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	SPINK1	P00995	79 aa		3.22	□□□□□ -1.89
RDM1-223	ENST00000619193	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1B0GU69	56 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193	UQCR11	O14957	56 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RDM1-223	ENST00000619193		H0YAA0	97 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	TNXB	P22105	4242 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	C9orf92	A6NGG3	77 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01554	Q52M75	96 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	CSAG1	Q6PB30	78 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	LPA	P08519	4548 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1B0GU33	70 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RDM1-223	ENST00000619193	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RDM1-223	ENST00000619193		P0C880	135 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RDM1-223	ENST00000619193	TPRXL	Q17RH7	258 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RDM1-223	ENST00000619193	ROMO1	P60602	79 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RDM1-223	ENST00000619193		S4R3F8	94 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP12-1	P59990	96 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193	CRIPT	Q9P021	101 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP12-2	P59991	146 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0D9SG42	100 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193		K7ERS5	55 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RDM1-223	ENST00000619193	MUC17	Q685J3	4493 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RDM1-223	ENST00000619193		M0QZ58	72 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193	SSPO	A2VEC9	5147 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0A0MQY5	61 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
RDM1-223	ENST00000619193	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193	MT1H	P80294	61 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193	USH2A	O75445	5202 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
RDM1-223	ENST00000619193		R4GN34	69 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RDM1-223	ENST00000619193	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
RDM1-223	ENST00000619193	NEB	P20929	6669 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RDM1-223	ENST00000619193	PLAC4	Q8WY50	150 aa		2.56	□□□□□ -2
RDM1-223	ENST00000619193	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.55	□□□□□ -2
RDM1-223	ENST00000619193	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.55	□□□□□ -2
RDM1-223	ENST00000619193		M0R2T5	61 aa		2.54	□□□□□ -2
RDM1-223	ENST00000619193	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		2.53	□□□□□ -2
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		2.52	□□□□□ -2.01

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