RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.51□□□□□ -0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 Q1T7F1 81 aa11.49□□□□□ -0.57
CAPNS1-212ENST00000591041 S4R3F8 94 aa11.44□□□□□ -0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa11.43□□□□□ -0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR15LQ9BU68 103 aa11.4□□□□□ -0.58
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC17Q685J3 4493 aa11.37□□□□□ -0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 SEC61GP60059 68 aa11.37□□□□□ -0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa11.37□□□□□ -0.59
CAPNS1-212ENST00000591041 FAT4Q6V0I7 4981 aa11.33□□□□□ -0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa11.3□□□□□ -0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GU69 56 aa11.28□□□□□ -0.6
CAPNS1-212ENST00000591041 LCA10Q71F78 164 aa11.27□□□□□ -0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 CSAG1Q6PB30 78 aa11.24□□□□□ -0.61
CAPNS1-212ENST00000591041 PSPHP1O15172 72 aa11.2□□□□□ -0.62
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-212ENST00000591041 Q5VV11 94 aa11.07□□□□□ -0.64
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NED7 52 aa11□□□□□ -0.65
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa10.99□□□□□ -0.65
CAPNS1-212ENST00000591041 H0YAA0 97 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-212ENST00000591041 FSIP2Q5CZC0 6907 aa10.97□□□□□ -0.65
CAPNS1-212ENST00000591041 UQCR11O14957 56 aa10.96□□□□□ -0.65
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A1B0GU33 70 aa10.9□□□□□ -0.66
CAPNS1-212ENST00000591041 CRCT1Q9UGL9 99 aa10.9□□□□□ -0.66
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
CAPNS1-212ENST00000591041 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.87□□□□□ -0.67
CAPNS1-212ENST00000591041 BRK1Q8WUW1 75 aa10.83□□□□□ -0.68
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2T5 61 aa10.8□□□□□ -0.68
CAPNS1-212ENST00000591041 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.79□□□□□ -0.68
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE2CQ5TA81 110 aa10.78□□□□□ -0.68
CAPNS1-212ENST00000591041 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.78□□□□□ -0.68
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.73□□□□□ -0.69
CAPNS1-212ENST00000591041 SPATA8Q6RVD6 105 aa10.71□□□□□ -0.69
CAPNS1-212ENST00000591041 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
CAPNS1-212ENST00000591041 M0QZ58 72 aa10.68□□□□□ -0.7
CAPNS1-212ENST00000591041 P0C880 135 aa10.67□□□□□ -0.7
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1HP80294 61 aa10.66□□□□□ -0.7
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO0628Q9UI54 55 aa10.63□□□□□ -0.71
CAPNS1-212ENST00000591041 CRIPTQ9P021 101 aa10.6□□□□□ -0.71
CAPNS1-212ENST00000591041 R4GN34 69 aa10.59□□□□□ -0.71
CAPNS1-212ENST00000591041 K7ERS5 55 aa10.55□□□□□ -0.72
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.38□□□□□ -0.75
CAPNS1-212ENST00000591041 A0A0D9SG42 100 aa10.37□□□□□ -0.75
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MU10 97 aa10.35□□□□□ -0.75
CAPNS1-212ENST00000591041 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-10P60014 251 aa10.31□□□□□ -0.76
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01554Q52M75 96 aa10.29□□□□□ -0.76
CAPNS1-212ENST00000591041 PMAIP1Q13794 54 aa10.28□□□□□ -0.76
CAPNS1-212ENST00000591041 MT2AP02795 61 aa10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-212ENST00000591041 A6NN06 94 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-212ENST00000591041 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.2□□□□□ -0.78
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1FP04733 61 aa10.14□□□□□ -0.79
CAPNS1-212ENST00000591041 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.13□□□□□ -0.79
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP12-1P59990 96 aa10.11□□□□□ -0.79
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP12-2P59991 146 aa10.04□□□□□ -0.8
CAPNS1-212ENST00000591041 PLAC4Q8WY50 150 aa10.01□□□□□ -0.81
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.97□□□□□ -0.81
CAPNS1-212ENST00000591041 ROMO1P60602 79 aa9.89□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 SSPOA2VEC9 5147 aa9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.87□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.85□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 USH2AO75445 5202 aa9.84□□□□□ -0.83
CAPNS1-212ENST00000591041 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CAPNS1-212ENST00000591041 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CAPNS1-212ENST00000591041 SVIPQ8NHG7 77 aa9.65□□□□□ -0.86
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1BP07438 61 aa9.6□□□□□ -0.87
CAPNS1-212ENST00000591041 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.58□□□□□ -0.88
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE2BO14633 110 aa9.57□□□□□ -0.88
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.54□□□□□ -0.88
CAPNS1-212ENST00000591041 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.52□□□□□ -0.89
CAPNS1-212ENST00000591041 TNP1P09430 55 aa9.48□□□□□ -0.89
CAPNS1-212ENST00000591041 PRAC1Q96KF2 57 aa9.41□□□□□ -0.9
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.32□□□□□ -0.92
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-5P60370 271 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-212ENST00000591041 MT1XP80297 61 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-212ENST00000591041 PP632Q6XCG6 107 aa9.3□□□□□ -0.92
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.28□□□□□ -0.92
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.24□□□□□ -0.93
CAPNS1-212ENST00000591041 NEBP20929 6669 aa9.07□□□□□ -0.96
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-12P60413 245 aa9□□□□□ -0.97
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.93□□□□□ -0.98
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.88□□□□□ -0.99
CAPNS1-212ENST00000591041 LCE3AQ5TA76 89 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.75□□□□□ -1.01
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP12-3P60328 96 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-212ENST00000591041 MDN1Q9NU22 5596 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP5-9P26371 169 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-212ENST00000591041 KMT2DO14686 5537 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.51□□□□□ -1.05
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.47□□□□□ -1.05
CAPNS1-212ENST00000591041 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.47□□□□□ -1.05
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