RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585326.5

GTF3C2-AS1-202, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 691 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MP68P56378 58 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.92□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q1T7F1 81 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q96NJ1 140 aa4.91□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LINC00208Q96KT6 92 aa4.89□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.88□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C9orf92A6NGG3 77 aa4.87□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 BRK1Q8WUW1 75 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SSPOA2VEC9 5147 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.85□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A0A1B0GVX0 72 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 V9GYY9 64 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 USH2AO75445 5202 aa4.82□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C1orf195Q5TG92 126 aa4.82□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LIMD2Q9BT23 127 aa4.81□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CD164Q04900 197 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q5VV11 94 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 COA5Q86WW8 74 aa4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A8MUN3 132 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PSPHP1O15172 72 aa4.77□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.76□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q75L30 129 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C8orf87E5RJ46 101 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.73□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PRR15LQ9BU68 103 aa4.72□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NDUFS5O43920 106 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 HRES1P13985 223 aa4.7□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 Q5W150 140 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.68□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A8MU10 97 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LCA10Q71F78 164 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 DMAC1Q96GE9 116 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A6NED7 52 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 IGKV2-30P06310 120 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PMAIP1Q13794 54 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MT2AP02795 61 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LINC00313P59037 77 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A6NN06 94 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ACYP2P14621 99 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MT1FP04733 61 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPINK7P58062 85 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP10-10P60014 251 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.52□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.51□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SEC61GP60059 68 aa4.5□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.5□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.5□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A8MUU9 505 aa4.49□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.49□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.49□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A0A1B0GU69 56 aa4.47□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.46□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 NEBP20929 6669 aa4.45□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.43□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 UQCR11O14957 56 aa4.4□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.39□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.39□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.39□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.35□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 PRAC1Q96KF2 57 aa4.3□□□□□ -1.72
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.29□□□□□ -1.72
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 H0YAA0 97 aa4.28□□□□□ -1.72
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.24□□□□□ -1.73
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A0A1B0GU33 70 aa4.21□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 LINC01554Q52M75 96 aa4.2□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MDN1Q9NU22 5596 aa4.18□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 CSAG1Q6PB30 78 aa4.17□□□□□ -1.74
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KMT2DO14686 5537 aa4.14□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP5-9P26371 169 aa4.14□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 MT1BP07438 61 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.12□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.11□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 S4R3F8 94 aa4.09□□□□□ -1.75
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.08□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 K7ERS5 55 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP10-5P60370 271 aa4.07□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.04□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 ROMO1P60602 79 aa4.03□□□□□ -1.76
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 A0A0A0MQY5 61 aa4.01□□□□□ -1.77
GTF3C2-AS1-202ENST00000585326 P0C880 135 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms