RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585236.5

TSPOAP1-AS1-211, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 BRK1Q8WUW1 75 aa13.45□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A0A1B0GU69 56 aa13.45□□□□□ -0.26
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A6NED7 52 aa13.35□□□□□ -0.27
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa13.32□□□□□ -0.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRO0628Q9UI54 55 aa13.31□□□□□ -0.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa13.3□□□□□ -0.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCA10Q71F78 164 aa13.28□□□□□ -0.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 S4R3F8 94 aa13.28□□□□□ -0.28
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa13.26□□□□□ -0.29
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SEC61GP60059 68 aa13.25□□□□□ -0.29
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 RNF213Q63HN8 5207 aa13.19□□□□□ -0.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa13.18□□□□□ -0.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A8MU10 97 aa13.16□□□□□ -0.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa13.16□□□□□ -0.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MUC17Q685J3 4493 aa13.16□□□□□ -0.3
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 UQCR11O14957 56 aa13.09□□□□□ -0.31
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MUC2Q02817 5179 aa13.01□□□□□ -0.33
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPATA8Q6RVD6 105 aa13□□□□□ -0.33
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MIR22HGQ0VDD5 57 aa12.98□□□□□ -0.33
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A0A1B0GU33 70 aa12.94□□□□□ -0.34
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CSAG1Q6PB30 78 aa12.94□□□□□ -0.34
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SVIPQ8NHG7 77 aa12.93□□□□□ -0.34
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa12.89□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.87□□□□□ -0.35
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 H0YAA0 97 aa12.81□□□□□ -0.36
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ADM2Q7Z4H4 148 aa12.74□□□□□ -0.37
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 P0C880 135 aa12.73□□□□□ -0.37
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PMAIP1Q13794 54 aa12.72□□□□□ -0.37
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A6NN06 94 aa12.61□□□□□ -0.39
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FAT4Q6V0I7 4981 aa12.59□□□□□ -0.39
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa12.58□□□□□ -0.4
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCE2CQ5TA81 110 aa12.45□□□□□ -0.42
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 M0QZ58 72 aa12.41□□□□□ -0.42
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 A0A0D9SG42 100 aa12.38□□□□□ -0.43
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 K7ERS5 55 aa12.31□□□□□ -0.44
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa12.29□□□□□ -0.44
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 R4GN34 69 aa12.25□□□□□ -0.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LORP23490 312 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT1HP80294 61 aa12.18□□□□□ -0.46
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP12-1P59990 96 aa12.12□□□□□ -0.47
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP12-2P59991 146 aa12.11□□□□□ -0.47
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 M0R2T5 61 aa12.08□□□□□ -0.48
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LINC01554Q52M75 96 aa12.06□□□□□ -0.48
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPINT4Q6UDR6 99 aa12.05□□□□□ -0.48
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CRIPTQ9P021 101 aa12.02□□□□□ -0.49
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRAC1Q96KF2 57 aa11.9□□□□□ -0.5
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 ROMO1P60602 79 aa11.88□□□□□ -0.51
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT2AP02795 61 aa11.77□□□□□ -0.52
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa11.77□□□□□ -0.52
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT1FP04733 61 aa11.72□□□□□ -0.53
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPRR2GQ9BYE4 73 aa11.7□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP10-10P60014 251 aa11.69□□□□□ -0.54
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa11.64□□□□□ -0.55
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa11.54□□□□□ -0.56
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa11.52□□□□□ -0.57
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 C10orf95Q9H7T3 257 aa11.45□□□□□ -0.58
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PLAC4Q8WY50 150 aa11.38□□□□□ -0.59
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa11.34□□□□□ -0.59
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.33□□□□□ -0.59
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FSIP2Q5CZC0 6907 aa11.24□□□□□ -0.61
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT1BP07438 61 aa11.18□□□□□ -0.62
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa11.13□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 CRCT1Q9UGL9 99 aa11.11□□□□□ -0.63
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCE2BO14633 110 aa11.08□□□□□ -0.64
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 USH2AO75445 5202 aa11.05□□□□□ -0.64
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 TNP1P09430 55 aa11.02□□□□□ -0.65
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT1XP80297 61 aa10.89□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP10-5P60370 271 aa10.88□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PP632Q6XCG6 107 aa10.87□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SSPOA2VEC9 5147 aa10.87□□□□□ -0.67
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP23-1A1A580 65 aa10.77□□□□□ -0.68
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 PRO2289Q9P1D8 64 aa10.7□□□□□ -0.7
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa10.56□□□□□ -0.72
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LCE3AQ5TA76 89 aa10.51□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP10-12P60413 245 aa10.43□□□□□ -0.74
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa10.3□□□□□ -0.76
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa10.29□□□□□ -0.76
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.07□□□□□ -0.8
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP12-3P60328 96 aa10.07□□□□□ -0.8
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.98□□□□□ -0.81
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.98□□□□□ -0.81
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa9.91□□□□□ -0.82
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KMT2DO14686 5537 aa9.82□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa9.79□□□□□ -0.84
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.75□□□□□ -0.85
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.7□□□□□ -0.86
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 NDUFAF8A1L188 74 aa9.63□□□□□ -0.87
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 LUZP6Q538Z0 58 aa9.6□□□□□ -0.87
TSPOAP1-AS1-211ENST00000585236 MT1EP04732 61 aa9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 153 ms