RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.58□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 A8MUN3 132 aa4.57□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.57□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 PCOTHQ58A44 107 aa4.57□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.57□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 DMAC1Q96GE9 116 aa4.57□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.56□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.56□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 A0A087X002 238 aa4.55□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.55□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2-30P06310 120 aa4.55□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 PSPHP1O15172 72 aa4.54□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 Q5VV11 94 aa4.54□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 Q5W150 140 aa4.54□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.54□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 KMT2DO14686 5537 aa4.53□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.53□□□□□ -1.68
GGA3-218ENST00000584243 HRES1P13985 223 aa4.52□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 MT1HP80294 61 aa4.52□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.52□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 A6NED7 52 aa4.51□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.51□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.51□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.51□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.5□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.5□□□□□ -1.69
GGA3-218ENST00000584243 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.46□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.46□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GU69 56 aa4.44□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.44□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 SEC61GP60059 68 aa4.43□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 PMAIP1Q13794 54 aa4.43□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 A8MUU9 505 aa4.42□□□□□ -1.7
GGA3-218ENST00000584243 UQCR11O14957 56 aa4.4□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 MDN1Q9NU22 5596 aa4.4□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.37□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 LCA10Q71F78 164 aa4.35□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.34□□□□□ -1.71
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.33□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.33□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.32□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 A6NN06 94 aa4.31□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.31□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 SPINK7P58062 85 aa4.3□□□□□ -1.72
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.27□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.27□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 C9orf92A6NGG3 77 aa4.25□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 TPRXLQ17RH7 258 aa4.24□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.24□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 K7ERS5 55 aa4.23□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.22□□□□□ -1.73
GGA3-218ENST00000584243 M0R2T5 61 aa4.2□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GU33 70 aa4.19□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 A8MU10 97 aa4.18□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.18□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 XP32Q5T750 250 aa4.17□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.16□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.16□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.16□□□□□ -1.74
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.15□□□□□ -1.75
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.14□□□□□ -1.75
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.13□□□□□ -1.75
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.13□□□□□ -1.75
GGA3-218ENST00000584243 S4R3F8 94 aa4.12□□□□□ -1.75
GGA3-218ENST00000584243 H0YAA0 97 aa4.08□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-9P26371 169 aa4.06□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.05□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 CSAG1Q6PB30 78 aa4.04□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 M0QZ58 72 aa4.03□□□□□ -1.76
GGA3-218ENST00000584243 LINC01554Q52M75 96 aa4.01□□□□□ -1.77
GGA3-218ENST00000584243 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.98□□□□□ -1.77
GGA3-218ENST00000584243 MT2AP02795 61 aa3.98□□□□□ -1.77
GGA3-218ENST00000584243 ROMO1P60602 79 aa3.97□□□□□ -1.77
GGA3-218ENST00000584243 MT1FP04733 61 aa3.96□□□□□ -1.78
GGA3-218ENST00000584243 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.94□□□□□ -1.78
GGA3-218ENST00000584243 PRAC1Q96KF2 57 aa3.93□□□□□ -1.78
GGA3-218ENST00000584243 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.91□□□□□ -1.78
GGA3-218ENST00000584243 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.88□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.87□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.87□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 A0A0A0MQY5 61 aa3.85□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 P0C880 135 aa3.85□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 CRIPTQ9P021 101 aa3.85□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 A0A0D9SG42 100 aa3.84□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 R4GN34 69 aa3.84□□□□□ -1.79
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.83□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2EP22531 72 aa3.82□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2BP35325 72 aa3.82□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2AP35326 72 aa3.82□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.81□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP12-1P59990 96 aa3.79□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-10P60014 251 aa3.78□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.78□□□□□ -1.8
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP12-2P59991 146 aa3.76□□□□□ -1.81
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.76□□□□□ -1.81
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