RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568468.5

GINS3-210, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene GINS3, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-210ENST00000568468 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.13□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 SERP2Q8N6R1 65 aa3.13□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 SNURFQ9Y675 71 aa3.13□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 MP68P56378 58 aa3.12□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 C5orf47Q569G3 176 aa3.12□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.12□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.12□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 HRES1P13985 223 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 COX7CP15954 63 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 KLKP1Q107X0 134 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 C20orf197Q8N268 126 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 MUC2Q02817 5179 aa3.11□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 RNF213Q63HN8 5207 aa3.1□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 A0A0U1RQV1 116 aa3.1□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 CCDC179H3BU77 68 aa3.1□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.1□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 C4orf26Q17RF5 130 aa3.09□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.09□□□□□ -1.91
GINS3-210ENST00000568468 H3BPC8 53 aa3.08□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.06□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 FAM236CP0DP71 79 aa3.06□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.06□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.05□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.05□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.05□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.03□□□□□ -1.92
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.02□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 H7BZZ5 65 aa3.01□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 MT1HP80294 61 aa2.99□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.99□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 DMAC1Q96GE9 116 aa2.98□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 NDUFC1O43677 76 aa2.97□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 S4R3F8 94 aa2.97□□□□□ -1.93
GINS3-210ENST00000568468 MT3P25713 68 aa2.96□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 LCA10Q71F78 164 aa2.96□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.96□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 A8MUN3 132 aa2.95□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 M0R2T5 61 aa2.95□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 ACYP2P14621 99 aa2.94□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 TMEM258P61165 79 aa2.93□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 COA5Q86WW8 74 aa2.93□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.92□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP5-9P26371 169 aa2.91□□□□□ -1.94
GINS3-210ENST00000568468 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 CSAG1Q6PB30 78 aa2.88□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 LCE1EQ5T753 118 aa2.85□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.85□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 MT2AP02795 61 aa2.84□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.84□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.84□□□□□ -1.95
GINS3-210ENST00000568468 MT1FP04733 61 aa2.83□□□□□ -1.96
GINS3-210ENST00000568468 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.83□□□□□ -1.96
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-10P60014 251 aa2.82□□□□□ -1.96
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.82□□□□□ -1.96
GINS3-210ENST00000568468 P0C880 135 aa2.81□□□□□ -1.96
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GINS3-210ENST00000568468 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.76□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GU69 56 aa2.75□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 SEC61GP60059 68 aa2.75□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.75□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.74□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 PRR15LQ9BU68 103 aa2.74□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 M0QZ58 72 aa2.73□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 PSPHP1O15172 72 aa2.73□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.72□□□□□ -1.97
GINS3-210ENST00000568468 Q1T7F1 81 aa2.71□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 LINC01554Q52M75 96 aa2.71□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.71□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 R4GN34 69 aa2.71□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 A0A1B0GU33 70 aa2.7□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 LCE1FQ5T754 118 aa2.7□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 Q5VV11 94 aa2.69□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 V9GYY9 64 aa2.69□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 A0A0D9SG42 100 aa2.68□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.68□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 CRIPTQ9P021 101 aa2.68□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.67□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 A8MU10 97 aa2.66□□□□□ -1.98
GINS3-210ENST00000568468 MT1BP07438 61 aa2.65□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-5P60370 271 aa2.65□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.65□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 UQCR11O14957 56 aa2.63□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 A6NED7 52 aa2.62□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP10-12P60413 245 aa2.62□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.62□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.62□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 USH2AO75445 5202 aa2.61□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.6□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP12-1P59990 96 aa2.59□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 KRTAP12-2P59991 146 aa2.59□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 PLAC4Q8WY50 150 aa2.59□□□□□ -1.99
GINS3-210ENST00000568468 SSPOA2VEC9 5147 aa2.57□□□□□ -2
GINS3-210ENST00000568468 A6NN06 94 aa2.56□□□□□ -2
GINS3-210ENST00000568468 PRAC1Q96KF2 57 aa2.55□□□□□ -2
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