RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 DMAC1Q96GE9 116 aa9.24□□□□□ -0.93
SPNS1-210ENST00000568388 MT1HP80294 61 aa9.21□□□□□ -0.94
SPNS1-210ENST00000568388 PCP4P48539 62 aa9.17□□□□□ -0.94
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.16□□□□□ -0.94
SPNS1-210ENST00000568388 ACYP2P14621 99 aa9.15□□□□□ -0.94
SPNS1-210ENST00000568388 LORP23490 312 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
SPNS1-210ENST00000568388 S4R3F8 94 aa9.13□□□□□ -0.95
SPNS1-210ENST00000568388 LCA10Q71F78 164 aa9.08□□□□□ -0.96
SPNS1-210ENST00000568388 M0R2T5 61 aa9.06□□□□□ -0.96
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM258P61165 79 aa9.06□□□□□ -0.96
SPNS1-210ENST00000568388 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SPNS1-210ENST00000568388 CSAG1Q6PB30 78 aa9□□□□□ -0.97
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SPNS1-210ENST00000568388 COA5Q86WW8 74 aa8.95□□□□□ -0.98
SPNS1-210ENST00000568388 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.94□□□□□ -0.98
SPNS1-210ENST00000568388 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.93□□□□□ -0.98
SPNS1-210ENST00000568388 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.91□□□□□ -0.98
SPNS1-210ENST00000568388 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.9□□□□□ -0.98
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.84□□□□□ -0.99
SPNS1-210ENST00000568388 H0YAA0 97 aa8.8□□□□□ -1
SPNS1-210ENST00000568388 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.78□□□□□ -1
SPNS1-210ENST00000568388 MT2AP02795 61 aa8.76□□□□□ -1.01
SPNS1-210ENST00000568388 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.73□□□□□ -1.01
SPNS1-210ENST00000568388 MT1FP04733 61 aa8.69□□□□□ -1.02
SPNS1-210ENST00000568388 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.67□□□□□ -1.02
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP10-10P60014 251 aa8.66□□□□□ -1.02
SPNS1-210ENST00000568388 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SPNS1-210ENST00000568388 P0C880 135 aa8.57□□□□□ -1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SEC61GP60059 68 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS1-210ENST00000568388 CRIPTQ9P021 101 aa8.55□□□□□ -1.04
SPNS1-210ENST00000568388 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.53□□□□□ -1.04
SPNS1-210ENST00000568388 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.5□□□□□ -1.05
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1B0GU69 56 aa8.48□□□□□ -1.05
SPNS1-210ENST00000568388 USH2AO75445 5202 aa8.47□□□□□ -1.05
SPNS1-210ENST00000568388 V9GYY9 64 aa8.45□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.44□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 SSPOA2VEC9 5147 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 Q1T7F1 81 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.43□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 PRR15LQ9BU68 103 aa8.42□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 R4GN34 69 aa8.4□□□□□ -1.06
SPNS1-210ENST00000568388 M0QZ58 72 aa8.37□□□□□ -1.07
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1B0GU33 70 aa8.35□□□□□ -1.07
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.29□□□□□ -1.08
SPNS1-210ENST00000568388 Q5VV11 94 aa8.28□□□□□ -1.08
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.27□□□□□ -1.09
SPNS1-210ENST00000568388 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.23□□□□□ -1.09
SPNS1-210ENST00000568388 PSPHP1O15172 72 aa8.23□□□□□ -1.09
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.19□□□□□ -1.1
SPNS1-210ENST00000568388 UQCR11O14957 56 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS1-210ENST00000568388 MT1BP07438 61 aa8.17□□□□□ -1.1
SPNS1-210ENST00000568388 LINC01554Q52M75 96 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS1-210ENST00000568388 A6NN06 94 aa8.13□□□□□ -1.11
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.09□□□□□ -1.11
SPNS1-210ENST00000568388 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SPNS1-210ENST00000568388 A0A0D9SG42 100 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS1-210ENST00000568388 PLAC4Q8WY50 150 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS1-210ENST00000568388 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.04□□□□□ -1.12
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.03□□□□□ -1.12
SPNS1-210ENST00000568388 A8MU10 97 aa8.01□□□□□ -1.13
SPNS1-210ENST00000568388 A6NED7 52 aa8□□□□□ -1.13
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP12-1P59990 96 aa7.96□□□□□ -1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SPNS1-210ENST00000568388 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.91□□□□□ -1.14
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP12-2P59991 146 aa7.89□□□□□ -1.15
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP10-5P60370 271 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS1-210ENST00000568388 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.84□□□□□ -1.15
SPNS1-210ENST00000568388 MT1XP80297 61 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS1-210ENST00000568388 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS1-210ENST00000568388 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS1-210ENST00000568388 K7ERS5 55 aa7.75□□□□□ -1.17
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.69□□□□□ -1.18
SPNS1-210ENST00000568388 LCE3BQ5TA77 95 aa7.65□□□□□ -1.18
SPNS1-210ENST00000568388 BRK1Q8WUW1 75 aa7.62□□□□□ -1.19
SPNS1-210ENST00000568388 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.56□□□□□ -1.2
SPNS1-210ENST00000568388 NEBP20929 6669 aa7.51□□□□□ -1.21
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.5□□□□□ -1.21
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.5□□□□□ -1.21
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP10-12P60413 245 aa7.45□□□□□ -1.22
SPNS1-210ENST00000568388 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.43□□□□□ -1.22
SPNS1-210ENST00000568388 TNP1P09430 55 aa7.4□□□□□ -1.22
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.37□□□□□ -1.23
SPNS1-210ENST00000568388 ROMO1P60602 79 aa7.37□□□□□ -1.23
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP5-9P26371 169 aa7.36□□□□□ -1.23
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.33□□□□□ -1.24
SPNS1-210ENST00000568388 PRO0628Q9UI54 55 aa7.31□□□□□ -1.24
SPNS1-210ENST00000568388 KMT2DO14686 5537 aa7.24□□□□□ -1.25
SPNS1-210ENST00000568388 PMAIP1Q13794 54 aa7.22□□□□□ -1.25
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.2□□□□□ -1.26
SPNS1-210ENST00000568388 MDN1Q9NU22 5596 aa7.19□□□□□ -1.26
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.17□□□□□ -1.26
SPNS1-210ENST00000568388 LCE1DQ5T752 114 aa7.15□□□□□ -1.26
SPNS1-210ENST00000568388 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.13□□□□□ -1.27
SPNS1-210ENST00000568388 LCE3AQ5TA76 89 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms