RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479		K7EQZ3	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	NDUFS5	O43920	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479		Q1T7F1	81 aa		4.56	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BPC8	53 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	MP68	P56378	58 aa		4.53	□□□□□ -1.68
KIFC3-231	ENST00000567479	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.52	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	USH2A	O75445	5202 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479		Q5W150	140 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479		Q8N9L7	120 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.5	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.49	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	SEC61G	P60059	68 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.48	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.47	□□□□□ -1.69
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.45	□□□□□ -1.7
KIFC3-231	ENST00000567479	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.43	□□□□□ -1.7
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.41	□□□□□ -1.7
KIFC3-231	ENST00000567479	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479		H0Y9P7	68 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	PSPHP1	O15172	72 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MUN3	132 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479		Q5VV11	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479		S4R3F8	94 aa		4.34	□□□□□ -1.71
KIFC3-231	ENST00000567479	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.33	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.32	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.32	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479		A6NED7	52 aa		4.31	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	LCA10	Q71F78	164 aa		4.3	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	COA5	Q86WW8	74 aa		4.3	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.3	□□□□□ -1.72
KIFC3-231	ENST00000567479	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.73
KIFC3-231	ENST00000567479	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.26	□□□□□ -1.73
KIFC3-231	ENST00000567479	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
KIFC3-231	ENST00000567479		A6NN06	94 aa		4.23	□□□□□ -1.73
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.23	□□□□□ -1.73
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1B	P07438	61 aa		4.21	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.21	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.21	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ACYP2	P14621	99 aa		4.2	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.17	□□□□□ -1.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.13	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479		H0YAA0	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GU69	56 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479		A8MU10	97 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479	UQCR11	O14957	56 aa		4.1	□□□□□ -1.75
KIFC3-231	ENST00000567479	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KIFC3-231	ENST00000567479	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KIFC3-231	ENST00000567479	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KIFC3-231	ENST00000567479	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KIFC3-231	ENST00000567479	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479		R4GN34	69 aa		3.99	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.98	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479	NEB	P20929	6669 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A0A0MQY5	61 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479		P0C880	135 aa		3.97	□□□□□ -1.77
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QZ58	72 aa		3.94	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MT1X	P80297	61 aa		3.94	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.93	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.93	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ERS5	55 aa		3.92	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.91	□□□□□ -1.78
KIFC3-231	ENST00000567479	KMT2D	O14686	5537 aa		3.87	□□□□□ -1.79
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.87	□□□□□ -1.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.86	□□□□□ -1.79
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.86	□□□□□ -1.79
KIFC3-231	ENST00000567479	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GU33	70 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2E	P22531	72 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2B	P35325	72 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2A	P35326	72 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.82	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.81	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.8	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.8	□□□□□ -1.8
KIFC3-231	ENST00000567479	ROMO1	P60602	79 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KIFC3-231	ENST00000567479	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
KIFC3-231	ENST00000567479	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.75	□□□□□ -1.81
KIFC3-231	ENST00000567479	SPRR2D	P22532	72 aa		3.7	□□□□□ -1.82
KIFC3-231	ENST00000567479	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.69	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms