RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 S4R3F8 94 aa7.52□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 PCP4P48539 62 aa7.51□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 ACYP2P14621 99 aa7.49□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 LCA10Q71F78 164 aa7.49□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 M0R2T5 61 aa7.48□□□□□ -1.21
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.45□□□□□ -1.22
CTU2-209ENST00000567316 TMEM258P61165 79 aa7.41□□□□□ -1.22
CTU2-209ENST00000567316 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.41□□□□□ -1.22
CTU2-209ENST00000567316 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CTU2-209ENST00000567316 CSAG1Q6PB30 78 aa7.39□□□□□ -1.23
CTU2-209ENST00000567316 COA5Q86WW8 74 aa7.36□□□□□ -1.23
CTU2-209ENST00000567316 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.34□□□□□ -1.23
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.29□□□□□ -1.24
CTU2-209ENST00000567316 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.28□□□□□ -1.24
CTU2-209ENST00000567316 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.27□□□□□ -1.25
CTU2-209ENST00000567316 MT2AP02795 61 aa7.24□□□□□ -1.25
CTU2-209ENST00000567316 H0YAA0 97 aa7.19□□□□□ -1.26
CTU2-209ENST00000567316 MT1FP04733 61 aa7.19□□□□□ -1.26
CTU2-209ENST00000567316 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.18□□□□□ -1.26
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-10P60014 251 aa7.15□□□□□ -1.26
CTU2-209ENST00000567316 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.11□□□□□ -1.27
CTU2-209ENST00000567316 P0C880 135 aa7.07□□□□□ -1.28
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.06□□□□□ -1.28
CTU2-209ENST00000567316 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CTU2-209ENST00000567316 SEC61GP60059 68 aa6.99□□□□□ -1.29
CTU2-209ENST00000567316 CRIPTQ9P021 101 aa6.99□□□□□ -1.29
CTU2-209ENST00000567316 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.99□□□□□ -1.29
CTU2-209ENST00000567316 LCE2BO14633 110 aa6.97□□□□□ -1.29
CTU2-209ENST00000567316 A0A1B0GU69 56 aa6.96□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.95□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 USH2AO75445 5202 aa6.94□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.94□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.93□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 R4GN34 69 aa6.9□□□□□ -1.3
CTU2-209ENST00000567316 Q1T7F1 81 aa6.89□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 PRR15LQ9BU68 103 aa6.89□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.88□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 M0QZ58 72 aa6.88□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 V9GYY9 64 aa6.88□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 SSPOA2VEC9 5147 aa6.86□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 A0A1B0GU33 70 aa6.85□□□□□ -1.31
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.83□□□□□ -1.32
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.82□□□□□ -1.32
CTU2-209ENST00000567316 PSPHP1O15172 72 aa6.78□□□□□ -1.32
CTU2-209ENST00000567316 Q5VV11 94 aa6.77□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.76□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 LINC01554Q52M75 96 aa6.75□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 MT1BP07438 61 aa6.74□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.74□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CTU2-209ENST00000567316 UQCR11O14957 56 aa6.69□□□□□ -1.34
CTU2-209ENST00000567316 A0A0D9SG42 100 aa6.65□□□□□ -1.34
CTU2-209ENST00000567316 A6NN06 94 aa6.63□□□□□ -1.35
CTU2-209ENST00000567316 A8MU10 97 aa6.62□□□□□ -1.35
CTU2-209ENST00000567316 PLAC4Q8WY50 150 aa6.62□□□□□ -1.35
CTU2-209ENST00000567316 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.59□□□□□ -1.35
CTU2-209ENST00000567316 A6NED7 52 aa6.56□□□□□ -1.36
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP12-1P59990 96 aa6.55□□□□□ -1.36
CTU2-209ENST00000567316 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.52□□□□□ -1.37
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP12-2P59991 146 aa6.51□□□□□ -1.37
CTU2-209ENST00000567316 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-5P60370 271 aa6.46□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 MT1XP80297 61 aa6.45□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.42□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.42□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.4□□□□□ -1.38
CTU2-209ENST00000567316 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.39□□□□□ -1.39
CTU2-209ENST00000567316 K7ERS5 55 aa6.33□□□□□ -1.4
CTU2-209ENST00000567316 BRK1Q8WUW1 75 aa6.26□□□□□ -1.41
CTU2-209ENST00000567316 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.23□□□□□ -1.41
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP10-12P60413 245 aa6.13□□□□□ -1.43
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP5-9P26371 169 aa6.1□□□□□ -1.43
CTU2-209ENST00000567316 TNP1P09430 55 aa6.06□□□□□ -1.44
CTU2-209ENST00000567316 NEBP20929 6669 aa6.05□□□□□ -1.44
CTU2-209ENST00000567316 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.03□□□□□ -1.44
CTU2-209ENST00000567316 ROMO1P60602 79 aa6.03□□□□□ -1.44
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.02□□□□□ -1.45
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.01□□□□□ -1.45
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.01□□□□□ -1.45
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.99□□□□□ -1.45
CTU2-209ENST00000567316 PRO0628Q9UI54 55 aa5.96□□□□□ -1.46
CTU2-209ENST00000567316 KMT2DO14686 5537 aa5.92□□□□□ -1.46
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.92□□□□□ -1.46
CTU2-209ENST00000567316 PMAIP1Q13794 54 aa5.9□□□□□ -1.46
CTU2-209ENST00000567316 LCE3AQ5TA76 89 aa5.88□□□□□ -1.47
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.86□□□□□ -1.47
CTU2-209ENST00000567316 MDN1Q9NU22 5596 aa5.84□□□□□ -1.47
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.81□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2EP22531 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2BP35325 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 SPRR2AP35326 72 aa5.81□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.81□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.8□□□□□ -1.48
CTU2-209ENST00000567316 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.76□□□□□ -1.49
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