RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533719.1

AIFM1-208, Transcript of apoptosis inducing factor mitochondria associated 1, human

TSL 2

Gene AIFM1, Length 845 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AIFM1-208	ENST00000533719	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		5.45	□□□□□ -1.54
AIFM1-208	ENST00000533719	LCE2C	Q5TA81	110 aa		5.44	□□□□□ -1.54
AIFM1-208	ENST00000533719		S4R3F8	94 aa		5.43	□□□□□ -1.54
AIFM1-208	ENST00000533719	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
AIFM1-208	ENST00000533719	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		5.4	□□□□□ -1.54
AIFM1-208	ENST00000533719	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		5.38	□□□□□ -1.55
AIFM1-208	ENST00000533719	LCA10	Q71F78	164 aa		5.36	□□□□□ -1.55
AIFM1-208	ENST00000533719	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		5.35	□□□□□ -1.55
AIFM1-208	ENST00000533719	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.31	□□□□□ -1.56
AIFM1-208	ENST00000533719	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	5.3	□□□□□ -1.56
AIFM1-208	ENST00000533719		V9GYY9	64 aa		5.29	□□□□□ -1.56
AIFM1-208	ENST00000533719	MUC2	Q02817	5179 aa		5.28	□□□□□ -1.56
AIFM1-208	ENST00000533719	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.27	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719		Q1T7F1	81 aa		5.24	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719	SEC61G	P60059	68 aa		5.23	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.23	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.23	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719		A0A1B0GU69	56 aa		5.22	□□□□□ -1.57
AIFM1-208	ENST00000533719		M0R2T5	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
AIFM1-208	ENST00000533719	MT1H	P80294	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
AIFM1-208	ENST00000533719	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
AIFM1-208	ENST00000533719	PSPHP1	O15172	72 aa		5.17	□□□□□ -1.58
AIFM1-208	ENST00000533719		H0YAA0	97 aa		5.16	□□□□□ -1.58
AIFM1-208	ENST00000533719	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.15	□□□□□ -1.59
AIFM1-208	ENST00000533719	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.13	□□□□□ -1.59
AIFM1-208	ENST00000533719		Q5VV11	94 aa		5.12	□□□□□ -1.59
AIFM1-208	ENST00000533719		P0C880	135 aa		5.08	□□□□□ -1.6
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
AIFM1-208	ENST00000533719		A0A1B0GU33	70 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AIFM1-208	ENST00000533719		A6NED7	52 aa		5.05	□□□□□ -1.6
AIFM1-208	ENST00000533719	UQCR11	O14957	56 aa		5.04	□□□□□ -1.6
AIFM1-208	ENST00000533719	MT2A	P02795	61 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIFM1-208	ENST00000533719		R4GN34	69 aa		4.99	□□□□□ -1.61
AIFM1-208	ENST00000533719		M0QZ58	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIFM1-208	ENST00000533719	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.98	□□□□□ -1.61
AIFM1-208	ENST00000533719	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	MT1F	P04733	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
AIFM1-208	ENST00000533719		A0A0D9SG42	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIFM1-208	ENST00000533719	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
AIFM1-208	ENST00000533719		A8MU10	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
AIFM1-208	ENST00000533719	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
AIFM1-208	ENST00000533719		K7ERS5	55 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.82	□□□□□ -1.64
AIFM1-208	ENST00000533719		A6NN06	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.79	□□□□□ -1.64
AIFM1-208	ENST00000533719	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.77	□□□□□ -1.65
AIFM1-208	ENST00000533719	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.76	□□□□□ -1.65
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP12-2	P59991	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.72	□□□□□ -1.65
AIFM1-208	ENST00000533719	PLAC4	Q8WY50	150 aa		4.71	□□□□□ -1.66
AIFM1-208	ENST00000533719	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.69	□□□□□ -1.66
AIFM1-208	ENST00000533719	MT1B	P07438	61 aa		4.67	□□□□□ -1.66
AIFM1-208	ENST00000533719	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.63	□□□□□ -1.67
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
AIFM1-208	ENST00000533719	ROMO1	P60602	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AIFM1-208	ENST00000533719	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		4.54	□□□□□ -1.68
AIFM1-208	ENST00000533719	MT1X	P80297	61 aa		4.5	□□□□□ -1.69
AIFM1-208	ENST00000533719	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AIFM1-208	ENST00000533719	USH2A	O75445	5202 aa		4.49	□□□□□ -1.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AIFM1-208	ENST00000533719	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.48	□□□□□ -1.69
AIFM1-208	ENST00000533719	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.46	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.44	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	TNP1	P09430	55 aa		4.43	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.42	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.42	□□□□□ -1.7
AIFM1-208	ENST00000533719	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.4	□□□□□ -1.71
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.39	□□□□□ -1.71
AIFM1-208	ENST00000533719	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.35	□□□□□ -1.71
AIFM1-208	ENST00000533719	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.33	□□□□□ -1.72
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP10-12	P60413	245 aa		4.32	□□□□□ -1.72
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
AIFM1-208	ENST00000533719	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.26	□□□□□ -1.73
AIFM1-208	ENST00000533719	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.24	□□□□□ -1.73
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.23	□□□□□ -1.73
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.21	□□□□□ -1.74
AIFM1-208	ENST00000533719	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.19	□□□□□ -1.74
AIFM1-208	ENST00000533719		H3BS24	57 aa		4.16	□□□□□ -1.74
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		4.12	□□□□□ -1.75
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.11	□□□□□ -1.75
AIFM1-208	ENST00000533719	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.06	□□□□□ -1.76
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIFM1-208	ENST00000533719	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.05	□□□□□ -1.76
AIFM1-208	ENST00000533719	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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