RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492698.1

LAMA5-211, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 3

Gene LAMA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-211ENST00000492698 NDUFC1O43677 76 aa6.56□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.55□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 MT2AP02795 61 aa6.55□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 FAM236CP0DP71 79 aa6.55□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.54□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 SPINK7P58062 85 aa6.53□□□□□ -1.36
LAMA5-211ENST00000492698 MT1FP04733 61 aa6.51□□□□□ -1.37
LAMA5-211ENST00000492698 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.48□□□□□ -1.37
LAMA5-211ENST00000492698 USH2AO75445 5202 aa6.47□□□□□ -1.37
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM258P61165 79 aa6.46□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.46□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 SSPOA2VEC9 5147 aa6.45□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.44□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP10-10P60014 251 aa6.41□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 C4orf26Q17RF5 130 aa6.4□□□□□ -1.38
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.37□□□□□ -1.39
LAMA5-211ENST00000492698 DMAC1Q96GE9 116 aa6.36□□□□□ -1.39
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.35□□□□□ -1.39
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.34□□□□□ -1.39
LAMA5-211ENST00000492698 H3BS24 57 aa6.32□□□□□ -1.4
LAMA5-211ENST00000492698 A8MUN3 132 aa6.31□□□□□ -1.4
LAMA5-211ENST00000492698 ACYP2P14621 99 aa6.3□□□□□ -1.4
LAMA5-211ENST00000492698 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
LAMA5-211ENST00000492698 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.28□□□□□ -1.4
LAMA5-211ENST00000492698 COA5Q86WW8 74 aa6.26□□□□□ -1.41
LAMA5-211ENST00000492698 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
LAMA5-211ENST00000492698 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.23□□□□□ -1.41
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.19□□□□□ -1.42
LAMA5-211ENST00000492698 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.17□□□□□ -1.42
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.16□□□□□ -1.42
LAMA5-211ENST00000492698 S4R3F8 94 aa6.15□□□□□ -1.42
LAMA5-211ENST00000492698 LCA10Q71F78 164 aa6.14□□□□□ -1.43
LAMA5-211ENST00000492698 LCE3BQ5TA77 95 aa6.1□□□□□ -1.43
LAMA5-211ENST00000492698 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.09□□□□□ -1.43
LAMA5-211ENST00000492698 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.08□□□□□ -1.44
LAMA5-211ENST00000492698 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
LAMA5-211ENST00000492698 CSAG1Q6PB30 78 aa6.02□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 Q1T7F1 81 aa6.01□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.01□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.01□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 V9GYY9 64 aa5.97□□□□□ -1.45
LAMA5-211ENST00000492698 MT1BP07438 61 aa5.96□□□□□ -1.46
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.93□□□□□ -1.46
LAMA5-211ENST00000492698 H0YAA0 97 aa5.91□□□□□ -1.46
LAMA5-211ENST00000492698 A0A1B0GU69 56 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMA5-211ENST00000492698 PRR15LQ9BU68 103 aa5.9□□□□□ -1.46
LAMA5-211ENST00000492698 PSPHP1O15172 72 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 SEC61GP60059 68 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.87□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 Q5VV11 94 aa5.85□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 A6NN06 94 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 P0C880 135 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP10-5P60370 271 aa5.79□□□□□ -1.48
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.78□□□□□ -1.48
LAMA5-211ENST00000492698 A0A1B0GU33 70 aa5.76□□□□□ -1.49
LAMA5-211ENST00000492698 UQCR11O14957 56 aa5.71□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.71□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 LCE1DQ5T752 114 aa5.7□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 A6NED7 52 aa5.69□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 NEBP20929 6669 aa5.68□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 M0QZ58 72 aa5.67□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.67□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 CRIPTQ9P021 101 aa5.67□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 LCE4AQ5TA78 99 aa5.65□□□□□ -1.5
LAMA5-211ENST00000492698 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.64□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 R4GN34 69 aa5.64□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP5-9P26371 169 aa5.62□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.62□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.6□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 A8MU10 97 aa5.59□□□□□ -1.51
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.57□□□□□ -1.52
LAMA5-211ENST00000492698 MT1XP80297 61 aa5.55□□□□□ -1.52
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.55□□□□□ -1.52
LAMA5-211ENST00000492698 BRK1Q8WUW1 75 aa5.55□□□□□ -1.52
LAMA5-211ENST00000492698 A0A0D9SG42 100 aa5.54□□□□□ -1.52
LAMA5-211ENST00000492698 LINC01554Q52M75 96 aa5.52□□□□□ -1.53
LAMA5-211ENST00000492698 KMT2DO14686 5537 aa5.5□□□□□ -1.53
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.5□□□□□ -1.53
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP12-1P59990 96 aa5.48□□□□□ -1.53
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP12-2P59991 146 aa5.45□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.45□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 PLAC4Q8WY50 150 aa5.43□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.42□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.42□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 PRO0628Q9UI54 55 aa5.41□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 MDN1Q9NU22 5596 aa5.41□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 SPRR2EP22531 72 aa5.4□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 SPRR2BP35325 72 aa5.4□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 SPRR2AP35326 72 aa5.4□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.4□□□□□ -1.54
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.38□□□□□ -1.55
LAMA5-211ENST00000492698 K7ERS5 55 aa5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 611.6 ms