RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCOTH	Q58A44	107 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF213	Q63HN8	5207 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		3.17	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEC61G	P60059	68 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFS5	O43920	106 aa		3.15	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCRQ	O14949	82 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	HRES1	P13985	223 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC2	Q02817	5179 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.13	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RQV1	116 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATOX1	O00244	68 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPINK7	P58062	85 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		3.12	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0Y9P7	68 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX7C	P15954	63 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00208	Q96KT6	92 aa		3.09	□□□□□ -1.91
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.08	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.07	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BPC8	53 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	MP68	P56378	58 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266		H7BZZ5	65 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3	□□□□□ -1.93
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1H	P80294	61 aa		3	□□□□□ -1.93
RABGGTB-212	ENST00000491266	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RABGGTB-212	ENST00000491266	DMAC1	Q96GE9	116 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RABGGTB-212	ENST00000491266	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		2.96	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		2.95	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCA10	Q71F78	164 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFC1	O43677	76 aa		2.93	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM236C	P0DP71	79 aa		2.92	□□□□□ -1.94
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MUN3	132 aa		2.9	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	COA5	Q86WW8	74 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266		S4R3F8	94 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACYP2	P14621	99 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM258	P61165	79 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT2A	P02795	61 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1F	P04733	61 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266		V9GYY9	64 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0R2T5	61 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	CSAG1	Q6PB30	78 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266		P0C880	135 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266		H0YAA0	97 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP10-10	P60014	251 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q1T7F1	81 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	USH2A	O75445	5202 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1B	P07438	61 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q5VV11	94 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GU69	56 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSPHP1	O15172	72 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE3A	Q5TA76	89 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR15L	Q9BU68	103 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GU33	70 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266		M0QZ58	72 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	SSPO	A2VEC9	5147 aa		2.65	□□□□□ -1.98
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRIPT	Q9P021	101 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266		R4GN34	69 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01554	Q52M75	96 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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