RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	8.21	□□□□□ -1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		8.2	□□□□□ -1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		8.2	□□□□□ -1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		8.19	□□□□□ -1.1
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		8.16	□□□□□ -1.1
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MUN3	132 aa		8.14	□□□□□ -1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		8.14	□□□□□ -1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	CSAG1	Q6PB30	78 aa		8.14	□□□□□ -1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	KLKP1	Q107X0	134 aa		8.13	□□□□□ -1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	LCA10	Q71F78	164 aa		8.1	□□□□□ -1.11
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFC1	O43677	76 aa		8.03	□□□□□ -1.12
HDAC10-216	ENST00000489424	SERP2	Q8N6R1	65 aa		8	□□□□□ -1.13
HDAC10-216	ENST00000489424	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	DMAC1	Q96GE9	116 aa		7.94	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		7.94	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SNURF	Q9Y675	71 aa		7.92	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	ACYP2	P14621	99 aa		7.91	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.91	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		7.85	□□□□□ -1.15
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7C	P15954	63 aa		7.83	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YAA0	97 aa		7.82	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		7.82	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		7.82	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		7.8	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		7.79	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	CRIPT	Q9P021	101 aa		7.78	□□□□□ -1.16
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		7.77	□□□□□ -1.17
HDAC10-216	ENST00000489424		Q5VV11	94 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		7.75	□□□□□ -1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.75	□□□□□ -1.17
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1B	P07438	61 aa		7.73	□□□□□ -1.17
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NN06	94 aa		7.69	□□□□□ -1.18
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-5	P60370	271 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HDAC10-216	ENST00000489424		H7BZZ5	65 aa		7.59	□□□□□ -1.19
HDAC10-216	ENST00000489424		R4GN34	69 aa		7.58	□□□□□ -1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	COA5	Q86WW8	74 aa		7.55	□□□□□ -1.2
HDAC10-216	ENST00000489424		P0C880	135 aa		7.53	□□□□□ -1.2
HDAC10-216	ENST00000489424	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		7.51	□□□□□ -1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.49	□□□□□ -1.21
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QZ58	72 aa		7.49	□□□□□ -1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		7.49	□□□□□ -1.21
HDAC10-216	ENST00000489424	SEC61G	P60059	68 aa		7.46	□□□□□ -1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	PLAC4	Q8WY50	150 aa		7.42	□□□□□ -1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP5-9	P26371	169 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		7.41	□□□□□ -1.22
HDAC10-216	ENST00000489424	NEB	P20929	6669 aa		7.39	□□□□□ -1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01554	Q52M75	96 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		7.37	□□□□□ -1.23
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM258	P61165	79 aa		7.32	□□□□□ -1.24
HDAC10-216	ENST00000489424	PCP4	P48539	62 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KMT2D	O14686	5537 aa		7.27	□□□□□ -1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		7.26	□□□□□ -1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1X	P80297	61 aa		7.24	□□□□□ -1.25
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GU69	56 aa		7.23	□□□□□ -1.25
HDAC10-216	ENST00000489424	MDN1	Q9NU22	5596 aa		7.21	□□□□□ -1.26
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GU33	70 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP12-2	P59991	146 aa		7.19	□□□□□ -1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR15L	Q9BU68	103 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		7.12	□□□□□ -1.27
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		7.08	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		7.06	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		7.06	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0D9SG42	100 aa		7.05	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		7.05	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		7.04	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		7.04	□□□□□ -1.28
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2E	P22531	72 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2B	P35325	72 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2A	P35326	72 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HDAC10-216	ENST00000489424		V9GYY9	64 aa		6.95	□□□□□ -1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-12	P60413	245 aa		6.94	□□□□□ -1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6.92	□□□□□ -1.3
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.89	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCR11	O14957	56 aa		6.89	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		6.89	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP12-1	P59990	96 aa		6.87	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424		A8MU10	97 aa		6.84	□□□□□ -1.31
HDAC10-216	ENST00000489424		Q1T7F1	81 aa		6.82	□□□□□ -1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR2D	P22532	72 aa		6.79	□□□□□ -1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		6.79	□□□□□ -1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		6.79	□□□□□ -1.32
HDAC10-216	ENST00000489424	PSPHP1	O15172	72 aa		6.75	□□□□□ -1.33
HDAC10-216	ENST00000489424	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.74	□□□□□ -1.33
HDAC10-216	ENST00000489424		K7ERS5	55 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.61	□□□□□ -1.35
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NED7	52 aa		6.6	□□□□□ -1.35
HDAC10-216	ENST00000489424	TNP1	P09430	55 aa		6.56	□□□□□ -1.36
HDAC10-216	ENST00000489424	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.52	□□□□□ -1.37
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		6.48	□□□□□ -1.37
HDAC10-216	ENST00000489424	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.45	□□□□□ -1.38
HDAC10-216	ENST00000489424	MT1E	P04732	61 aa		6.43	□□□□□ -1.38
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.42	□□□□□ -1.38

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