RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.11□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.11□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 A8MUN3 132 aa6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 S4R3F8 94 aa6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HPS1-211ENST00000478087 CSAG1Q6PB30 78 aa6.04□□□□□ -1.44
HPS1-211ENST00000478087 KLKP1Q107X0 134 aa6.03□□□□□ -1.44
HPS1-211ENST00000478087 LCA10Q71F78 164 aa6□□□□□ -1.45
HPS1-211ENST00000478087 SERP2Q8N6R1 65 aa5.97□□□□□ -1.45
HPS1-211ENST00000478087 NDUFC1O43677 76 aa5.96□□□□□ -1.46
HPS1-211ENST00000478087 DMAC1Q96GE9 116 aa5.94□□□□□ -1.46
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.91□□□□□ -1.46
HPS1-211ENST00000478087 MT1BP07438 61 aa5.87□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 ACYP2P14621 99 aa5.87□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 C20orf197Q8N268 126 aa5.87□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 H0YAA0 97 aa5.86□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.86□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 SNURFQ9Y675 71 aa5.86□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 COX7CP15954 63 aa5.85□□□□□ -1.47
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.83□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.81□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.81□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.81□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 CRIPTQ9P021 101 aa5.81□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 Q5VV11 94 aa5.79□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 A6NN06 94 aa5.78□□□□□ -1.48
HPS1-211ENST00000478087 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.76□□□□□ -1.49
HPS1-211ENST00000478087 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.76□□□□□ -1.49
HPS1-211ENST00000478087 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.72□□□□□ -1.49
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-5P60370 271 aa5.71□□□□□ -1.5
HPS1-211ENST00000478087 NEBP20929 6669 aa5.68□□□□□ -1.5
HPS1-211ENST00000478087 H7BZZ5 65 aa5.67□□□□□ -1.5
HPS1-211ENST00000478087 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.67□□□□□ -1.5
HPS1-211ENST00000478087 COA5Q86WW8 74 aa5.62□□□□□ -1.51
HPS1-211ENST00000478087 R4GN34 69 aa5.6□□□□□ -1.51
HPS1-211ENST00000478087 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
HPS1-211ENST00000478087 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.59□□□□□ -1.51
HPS1-211ENST00000478087 P0C880 135 aa5.58□□□□□ -1.52
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.58□□□□□ -1.52
HPS1-211ENST00000478087 CCDC179H3BU77 68 aa5.57□□□□□ -1.52
HPS1-211ENST00000478087 KMT2DO14686 5537 aa5.55□□□□□ -1.52
HPS1-211ENST00000478087 M0QZ58 72 aa5.54□□□□□ -1.52
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP5-9P26371 169 aa5.52□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 SEC61GP60059 68 aa5.52□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.52□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.49□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 TMEM258P61165 79 aa5.48□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 MT1XP80297 61 aa5.48□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 MDN1Q9NU22 5596 aa5.47□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 PLAC4Q8WY50 150 aa5.47□□□□□ -1.53
HPS1-211ENST00000478087 PCP4P48539 62 aa5.45□□□□□ -1.54
HPS1-211ENST00000478087 LINC01554Q52M75 96 aa5.41□□□□□ -1.54
HPS1-211ENST00000478087 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.4□□□□□ -1.54
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.37□□□□□ -1.55
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GU69 56 aa5.36□□□□□ -1.55
HPS1-211ENST00000478087 A0A1B0GU33 70 aa5.34□□□□□ -1.55
HPS1-211ENST00000478087 PRR15LQ9BU68 103 aa5.33□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.32□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.31□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2EP22531 72 aa5.3□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2BP35325 72 aa5.3□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2AP35326 72 aa5.3□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP12-2P59991 146 aa5.29□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.29□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.28□□□□□ -1.56
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.26□□□□□ -1.57
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.26□□□□□ -1.57
HPS1-211ENST00000478087 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.24□□□□□ -1.57
HPS1-211ENST00000478087 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.24□□□□□ -1.57
HPS1-211ENST00000478087 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.21□□□□□ -1.58
HPS1-211ENST00000478087 V9GYY9 64 aa5.2□□□□□ -1.58
HPS1-211ENST00000478087 A0A0D9SG42 100 aa5.19□□□□□ -1.58
HPS1-211ENST00000478087 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.19□□□□□ -1.58
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP10-12P60413 245 aa5.18□□□□□ -1.58
HPS1-211ENST00000478087 UQCR11O14957 56 aa5.13□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.13□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 SPRR2DP22532 72 aa5.12□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP12-1P59990 96 aa5.11□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 Q1T7F1 81 aa5.1□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.09□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.08□□□□□ -1.6
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.08□□□□□ -1.6
HPS1-211ENST00000478087 A8MU10 97 aa5.05□□□□□ -1.6
HPS1-211ENST00000478087 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5□□□□□ -1.61
HPS1-211ENST00000478087 PSPHP1O15172 72 aa4.99□□□□□ -1.61
HPS1-211ENST00000478087 LCE3BQ5TA77 95 aa4.99□□□□□ -1.61
HPS1-211ENST00000478087 K7ERS5 55 aa4.95□□□□□ -1.62
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.91□□□□□ -1.62
HPS1-211ENST00000478087 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
HPS1-211ENST00000478087 A6NED7 52 aa4.89□□□□□ -1.63
HPS1-211ENST00000478087 TNP1P09430 55 aa4.88□□□□□ -1.63
HPS1-211ENST00000478087 SVIPQ8NHG7 77 aa4.88□□□□□ -1.63
HPS1-211ENST00000478087 MT1EP04732 61 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms