RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 PCP4P48539 62 aa4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 LCA10Q71F78 164 aa4.56□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 CSAG1Q6PB30 78 aa4.55□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM258P61165 79 aa4.53□□□□□ -1.68
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.52□□□□□ -1.69
SH3BP4-208ENST00000462602 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.51□□□□□ -1.69
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SH3BP4-208ENST00000462602 COA5Q86WW8 74 aa4.49□□□□□ -1.69
SH3BP4-208ENST00000462602 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP4-208ENST00000462602 H0YAA0 97 aa4.42□□□□□ -1.7
SH3BP4-208ENST00000462602 MT2AP02795 61 aa4.4□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-10P60014 251 aa4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.39□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.37□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1FP04733 61 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC61GP60059 68 aa4.34□□□□□ -1.71
SH3BP4-208ENST00000462602 CRIPTQ9P021 101 aa4.32□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.31□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 P0C880 135 aa4.29□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.28□□□□□ -1.72
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GU69 56 aa4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR15LQ9BU68 103 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 R4GN34 69 aa4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 V9GYY9 64 aa4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 M0QZ58 72 aa4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.22□□□□□ -1.73
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GU33 70 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4-208ENST00000462602 Q1T7F1 81 aa4.21□□□□□ -1.74
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.19□□□□□ -1.74
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE2BO14633 110 aa4.18□□□□□ -1.74
SH3BP4-208ENST00000462602 Q5VV11 94 aa4.17□□□□□ -1.74
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.15□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01554Q52M75 96 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PSPHP1O15172 72 aa4.13□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.12□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCR11O14957 56 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NN06 94 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1BP07438 61 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 PLAC4Q8WY50 150 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP4-208ENST00000462602 USH2AO75445 5202 aa4.07□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0D9SG42 100 aa4.06□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.05□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.04□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NED7 52 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MU10 97 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4□□□□□ -1.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SPINT4Q6UDR6 99 aa4□□□□□ -1.77
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP12-1P59990 96 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP4-208ENST00000462602 SSPOA2VEC9 5147 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.96□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP12-2P59991 146 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-5P60370 271 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 K7ERS5 55 aa3.94□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1XP80297 61 aa3.91□□□□□ -1.78
SH3BP4-208ENST00000462602 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
SH3BP4-208ENST00000462602 BRK1Q8WUW1 75 aa3.82□□□□□ -1.8
SH3BP4-208ENST00000462602 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.77□□□□□ -1.81
SH3BP4-208ENST00000462602 TNP1P09430 55 aa3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-12P60413 245 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
SH3BP4-208ENST00000462602 ROMO1P60602 79 aa3.7□□□□□ -1.82
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.69□□□□□ -1.82
SH3BP4-208ENST00000462602 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
SH3BP4-208ENST00000462602 PRO0628Q9UI54 55 aa3.64□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 PMAIP1Q13794 54 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.61□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.59□□□□□ -1.83
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE3AQ5TA76 89 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 KMT2DO14686 5537 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP5-9P26371 169 aa3.56□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 PP632Q6XCG6 107 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.53□□□□□ -1.84
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.49□□□□□ -1.85
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP12-3P60328 96 aa3.46□□□□□ -1.86
SH3BP4-208ENST00000462602 MT1EP04732 61 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2EP22531 72 aa3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2BP35325 72 aa3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRR2AP35326 72 aa3.41□□□□□ -1.86
SH3BP4-208ENST00000462602 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.4□□□□□ -1.87
SH3BP4-208ENST00000462602 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.4□□□□□ -1.87
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