RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMAIP1Q13794 54 aa5.04□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.04□□□□□ -1.6
CCNDBP1-202ENST00000444658 TPRXLQ17RH7 258 aa5.02□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf92A6NGG3 77 aa5.01□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2-30P06310 120 aa5□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCOTHQ58A44 107 aa4.99□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.99□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.99□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR4Q16378 134 aa4.98□□□□□ -1.61
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.95□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSPHP1O15172 72 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 HRES1P13985 223 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q5VV11 94 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 COA5Q86WW8 74 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 DMAC1Q96GE9 116 aa4.93□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACYP2P14621 99 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MUN3 132 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-202ENST00000444658 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.89□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.89□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.88□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.88□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.88□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK7P58062 85 aa4.88□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.87□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRR15LQ9BU68 103 aa4.86□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.86□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.85□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRP2P98164 4655 aa4.83□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 LPAP08519 4548 aa4.83□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 A6NED7 52 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUC17Q685J3 4493 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERC1Q15751 4861 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 A6NN06 94 aa4.8□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCA10Q71F78 164 aa4.79□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.78□□□□□ -1.64
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.77□□□□□ -1.65
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.77□□□□□ -1.65
CCNDBP1-202ENST00000444658 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.76□□□□□ -1.65
CCNDBP1-202ENST00000444658 A8MU10 97 aa4.72□□□□□ -1.65
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GU69 56 aa4.68□□□□□ -1.66
CCNDBP1-202ENST00000444658 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.66□□□□□ -1.66
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.65□□□□□ -1.66
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.61□□□□□ -1.67
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.59□□□□□ -1.67
CCNDBP1-202ENST00000444658 S4R3F8 94 aa4.59□□□□□ -1.67
CCNDBP1-202ENST00000444658 UQCR11O14957 56 aa4.58□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUC2Q02817 5179 aa4.57□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.54□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.54□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01554Q52M75 96 aa4.54□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSAG1Q6PB30 78 aa4.54□□□□□ -1.68
CCNDBP1-202ENST00000444658 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCNDBP1-202ENST00000444658 H0YAA0 97 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF213Q63HN8 5207 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GU33 70 aa4.49□□□□□ -1.69
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRAC1Q96KF2 57 aa4.46□□□□□ -1.7
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
CCNDBP1-202ENST00000444658 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT1HP80294 61 aa4.37□□□□□ -1.71
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.36□□□□□ -1.71
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0QZ58 72 aa4.34□□□□□ -1.71
CCNDBP1-202ENST00000444658 K7ERS5 55 aa4.33□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 P0C880 135 aa4.33□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.31□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRIPTQ9P021 101 aa4.3□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0R2T5 61 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.29□□□□□ -1.72
CCNDBP1-202ENST00000444658 R4GN34 69 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-202ENST00000444658 ROMO1P60602 79 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.24□□□□□ -1.73
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0D9SG42 100 aa4.2□□□□□ -1.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT2AP02795 61 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP12-1P59990 96 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.18□□□□□ -1.74
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-10P60014 251 aa4.15□□□□□ -1.75
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CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP12-2P59991 146 aa4.14□□□□□ -1.75
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.11□□□□□ -1.75
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.05□□□□□ -1.76
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLAC4Q8WY50 150 aa4.01□□□□□ -1.77
CCNDBP1-202ENST00000444658 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.95□□□□□ -1.78
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT1BP07438 61 aa3.94□□□□□ -1.78
CCNDBP1-202ENST00000444658 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.92□□□□□ -1.78
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CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.9□□□□□ -1.79
CCNDBP1-202ENST00000444658 NDUFAF8A1L188 74 aa3.86□□□□□ -1.79
CCNDBP1-202ENST00000444658 PP632Q6XCG6 107 aa3.86□□□□□ -1.79
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.84□□□□□ -1.8
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNP1P09430 55 aa3.83□□□□□ -1.8
CCNDBP1-202ENST00000444658 USH2AO75445 5202 aa3.82□□□□□ -1.8
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-5P60370 271 aa3.82□□□□□ -1.8
CCNDBP1-202ENST00000444658 MT1XP80297 61 aa3.82□□□□□ -1.8
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.75□□□□□ -1.81
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