RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437111.1

SHQ1P1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor pseudogene 1, humanhuman

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Gene SHQ1P1, Length 1,544 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1P1-201ENST00000437111 PCOTHQ58A44 107 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRO0628Q9UI54 55 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 COA5Q86WW8 74 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.61□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP10-8P60410 259 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 BRK1Q8WUW1 75 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1P1-201ENST00000437111 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.59□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 ACYP2P14621 99 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q5W150 140 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2-30P06310 120 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR15LQ9BU68 103 aa3.55□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 PSPHP1O15172 72 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 DMAC1Q96GE9 116 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q75L30 129 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 HRES1P13985 223 aa3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.53□□□□□ -1.84
SHQ1P1-201ENST00000437111 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MUN3 132 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 A6NED7 52 aa3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 Q5VV11 94 aa3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.5□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.47□□□□□ -1.85
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MUU9 505 aa3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.46□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GU69 56 aa3.45□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 C9orf92A6NGG3 77 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEC61GP60059 68 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0A0MQY5 61 aa3.43□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC17Q685J3 4493 aa3.42□□□□□ -1.86
SHQ1P1-201ENST00000437111 UQCR11O14957 56 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 PMAIP1Q13794 54 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPINK7P58062 85 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCA10Q71F78 164 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.32□□□□□ -1.88
SHQ1P1-201ENST00000437111 A6NN06 94 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1P1-201ENST00000437111 A8MU10 97 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P1-201ENST00000437111 TPRXLQ17RH7 258 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1P1-201ENST00000437111 K7ERS5 55 aa3.27□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A1B0GU33 70 aa3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 S4R3F8 94 aa3.26□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.25□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT1HP80294 61 aa3.24□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.22□□□□□ -1.89
SHQ1P1-201ENST00000437111 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 SSPOA2VEC9 5147 aa3.19□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 H0YAA0 97 aa3.19□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 USH2AO75445 5202 aa3.17□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 CSAG1Q6PB30 78 aa3.16□□□□□ -1.9
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0R2T5 61 aa3.13□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 M0QZ58 72 aa3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
SHQ1P1-201ENST00000437111 PRAC1Q96KF2 57 aa3.09□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 ROMO1P60602 79 aa3.07□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 A0A0D9SG42 100 aa3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 LINC01554Q52M75 96 aa3.06□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 P0C880 135 aa3.05□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 R4GN34 69 aa3.03□□□□□ -1.92
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.01□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 SPINT4Q6UDR6 99 aa3□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.99□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 CRIPTQ9P021 101 aa2.98□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 NEBP20929 6669 aa2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP12-1P59990 96 aa2.97□□□□□ -1.93
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP12-2P59991 146 aa2.96□□□□□ -1.94
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT2AP02795 61 aa2.94□□□□□ -1.94
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.93□□□□□ -1.94
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.93□□□□□ -1.94
SHQ1P1-201ENST00000437111 MT1FP04733 61 aa2.92□□□□□ -1.94
SHQ1P1-201ENST00000437111 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.9□□□□□ -1.95
SHQ1P1-201ENST00000437111 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.88□□□□□ -1.95
SHQ1P1-201ENST00000437111 KRTAP10-10P60014 251 aa2.87□□□□□ -1.95
SHQ1P1-201ENST00000437111 PP632Q6XCG6 107 aa2.83□□□□□ -1.96
SHQ1P1-201ENST00000437111 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.82□□□□□ -1.96
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