RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418548.3

SFTA3-201, Transcript of surfactant associated 3, humanhuman

TSL 3

Gene SFTA3, Length 870 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3-201ENST00000418548 COX7CP15954 63 aa7.35□□□□□ -1.23
SFTA3-201ENST00000418548 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.35□□□□□ -1.23
SFTA3-201ENST00000418548 A0A0U1RQV1 116 aa7.34□□□□□ -1.23
SFTA3-201ENST00000418548 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.34□□□□□ -1.23
SFTA3-201ENST00000418548 C20orf197Q8N268 126 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTA3-201ENST00000418548 KLKP1Q107X0 134 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTA3-201ENST00000418548 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTA3-201ENST00000418548 SNURFQ9Y675 71 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTA3-201ENST00000418548 C4orf26Q17RF5 130 aa7.25□□□□□ -1.25
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.24□□□□□ -1.25
SFTA3-201ENST00000418548 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.23□□□□□ -1.25
SFTA3-201ENST00000418548 CCDC179H3BU77 68 aa7.19□□□□□ -1.26
SFTA3-201ENST00000418548 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTA3-201ENST00000418548 FAM236CP0DP71 79 aa7.18□□□□□ -1.26
SFTA3-201ENST00000418548 NDUFC1O43677 76 aa7.16□□□□□ -1.26
SFTA3-201ENST00000418548 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.15□□□□□ -1.26
SFTA3-201ENST00000418548 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.15□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.14□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 H7BZZ5 65 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.13□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 A8MUN3 132 aa7.12□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 DMAC1Q96GE9 116 aa7.09□□□□□ -1.27
SFTA3-201ENST00000418548 MT1HP80294 61 aa7.06□□□□□ -1.28
SFTA3-201ENST00000418548 PCP4P48539 62 aa7.05□□□□□ -1.28
SFTA3-201ENST00000418548 ACYP2P14621 99 aa7.01□□□□□ -1.29
SFTA3-201ENST00000418548 S4R3F8 94 aa6.99□□□□□ -1.29
SFTA3-201ENST00000418548 LCA10Q71F78 164 aa6.97□□□□□ -1.29
SFTA3-201ENST00000418548 TMEM258P61165 79 aa6.95□□□□□ -1.3
SFTA3-201ENST00000418548 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
SFTA3-201ENST00000418548 M0R2T5 61 aa6.93□□□□□ -1.3
SFTA3-201ENST00000418548 CSAG1Q6PB30 78 aa6.9□□□□□ -1.3
SFTA3-201ENST00000418548 COA5Q86WW8 74 aa6.87□□□□□ -1.31
SFTA3-201ENST00000418548 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.85□□□□□ -1.31
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SFTA3-201ENST00000418548 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.81□□□□□ -1.32
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.79□□□□□ -1.32
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.79□□□□□ -1.32
SFTA3-201ENST00000418548 H0YAA0 97 aa6.74□□□□□ -1.33
SFTA3-201ENST00000418548 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.74□□□□□ -1.33
SFTA3-201ENST00000418548 MT2AP02795 61 aa6.72□□□□□ -1.33
SFTA3-201ENST00000418548 SVIPQ8NHG7 77 aa6.72□□□□□ -1.33
SFTA3-201ENST00000418548 MT1FP04733 61 aa6.67□□□□□ -1.34
SFTA3-201ENST00000418548 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.65□□□□□ -1.34
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP10-10P60014 251 aa6.64□□□□□ -1.35
SFTA3-201ENST00000418548 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SFTA3-201ENST00000418548 P0C880 135 aa6.58□□□□□ -1.36
SFTA3-201ENST00000418548 CRIPTQ9P021 101 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTA3-201ENST00000418548 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.55□□□□□ -1.36
SFTA3-201ENST00000418548 SEC61GP60059 68 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.54□□□□□ -1.36
SFTA3-201ENST00000418548 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.52□□□□□ -1.37
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1B0GU69 56 aa6.5□□□□□ -1.37
SFTA3-201ENST00000418548 Q1T7F1 81 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTA3-201ENST00000418548 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.48□□□□□ -1.37
SFTA3-201ENST00000418548 V9GYY9 64 aa6.47□□□□□ -1.37
SFTA3-201ENST00000418548 PRR15LQ9BU68 103 aa6.45□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 R4GN34 69 aa6.43□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.42□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 M0QZ58 72 aa6.42□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.42□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 A0A1B0GU33 70 aa6.41□□□□□ -1.38
SFTA3-201ENST00000418548 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.39□□□□□ -1.39
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.36□□□□□ -1.39
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.36□□□□□ -1.39
SFTA3-201ENST00000418548 Q5VV11 94 aa6.35□□□□□ -1.39
SFTA3-201ENST00000418548 PSPHP1O15172 72 aa6.33□□□□□ -1.4
SFTA3-201ENST00000418548 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.29□□□□□ -1.4
SFTA3-201ENST00000418548 UQCR11O14957 56 aa6.27□□□□□ -1.41
SFTA3-201ENST00000418548 MT1BP07438 61 aa6.27□□□□□ -1.41
SFTA3-201ENST00000418548 LINC01554Q52M75 96 aa6.26□□□□□ -1.41
SFTA3-201ENST00000418548 USH2AO75445 5202 aa6.25□□□□□ -1.41
SFTA3-201ENST00000418548 A6NN06 94 aa6.23□□□□□ -1.41
SFTA3-201ENST00000418548 A0A0D9SG42 100 aa6.18□□□□□ -1.42
SFTA3-201ENST00000418548 SSPOA2VEC9 5147 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTA3-201ENST00000418548 PLAC4Q8WY50 150 aa6.17□□□□□ -1.42
SFTA3-201ENST00000418548 A8MU10 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTA3-201ENST00000418548 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.16□□□□□ -1.42
SFTA3-201ENST00000418548 A6NED7 52 aa6.13□□□□□ -1.43
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP12-1P59990 96 aa6.11□□□□□ -1.43
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.1□□□□□ -1.43
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP12-2P59991 146 aa6.06□□□□□ -1.44
SFTA3-201ENST00000418548 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.06□□□□□ -1.44
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP10-5P60370 271 aa6.02□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.02□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 MT1XP80297 61 aa6□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.98□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.97□□□□□ -1.45
SFTA3-201ENST00000418548 K7ERS5 55 aa5.93□□□□□ -1.46
SFTA3-201ENST00000418548 BRK1Q8WUW1 75 aa5.85□□□□□ -1.47
SFTA3-201ENST00000418548 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.8□□□□□ -1.48
SFTA3-201ENST00000418548 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SFTA3-201ENST00000418548 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.74□□□□□ -1.49
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
SFTA3-201ENST00000418548 KRTAP10-12P60413 245 aa5.72□□□□□ -1.49
SFTA3-201ENST00000418548 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
SFTA3-201ENST00000418548 TNP1P09430 55 aa5.67□□□□□ -1.5
SFTA3-201ENST00000418548 ROMO1P60602 79 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms