RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.32□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A087WVE0 104 aa8.31□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UQCRQO14949 82 aa8.31□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.28□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.28□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 S4R3F8 94 aa8.28□□□□□ -1.08
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 H0Y9P7 68 aa8.25□□□□□ -1.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COX7CP15954 63 aa8.25□□□□□ -1.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C5orf47Q569G3 176 aa8.24□□□□□ -1.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SERP2Q8N6R1 65 aa8.23□□□□□ -1.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCA10Q71F78 164 aa8.22□□□□□ -1.09
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCDC179H3BU77 68 aa8.2□□□□□ -1.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CSAG1Q6PB30 78 aa8.2□□□□□ -1.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OCR1Q9BZK8 76 aa8.18□□□□□ -1.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SVIPQ8NHG7 77 aa8.16□□□□□ -1.1
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.14□□□□□ -1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.13□□□□□ -1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.12□□□□□ -1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LINC00208Q96KT6 92 aa8.12□□□□□ -1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MP68P56378 58 aa8.11□□□□□ -1.11
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLKP1Q107X0 134 aa8.07□□□□□ -1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A8MUN3 132 aa8.06□□□□□ -1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 H3BPC8 53 aa8.04□□□□□ -1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM258P61165 79 aa8.04□□□□□ -1.12
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NDUFC1O43677 76 aa8.02□□□□□ -1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.98□□□□□ -1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C20orf197Q8N268 126 aa7.97□□□□□ -1.13
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 H0YAA0 97 aa7.93□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.92□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NEBP20929 6669 aa7.9□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CRIPTQ9P021 101 aa7.9□□□□□ -1.14
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MT1BP07438 61 aa7.89□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCE3BQ5TA77 95 aa7.89□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.88□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 Q5VV11 94 aa7.87□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DMAC1Q96GE9 116 aa7.87□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 H7BZZ5 65 aa7.86□□□□□ -1.15
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.83□□□□□ -1.16
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SNURFQ9Y675 71 aa7.83□□□□□ -1.16
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.81□□□□□ -1.16
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.79□□□□□ -1.16
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.78□□□□□ -1.16
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.74□□□□□ -1.17
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.72□□□□□ -1.17
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.72□□□□□ -1.17
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A6NN06 94 aa7.71□□□□□ -1.18
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ACYP2P14621 99 aa7.69□□□□□ -1.18
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP10-5P60370 271 aa7.68□□□□□ -1.18
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.65□□□□□ -1.18
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.64□□□□□ -1.19
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 P0C880 135 aa7.64□□□□□ -1.19
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.63□□□□□ -1.19
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 R4GN34 69 aa7.58□□□□□ -1.2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.57□□□□□ -1.2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 M0QZ58 72 aa7.53□□□□□ -1.2
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.52□□□□□ -1.21
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP5-9P26371 169 aa7.49□□□□□ -1.21
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 V9GYY9 64 aa7.48□□□□□ -1.21
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLAC4Q8WY50 150 aa7.47□□□□□ -1.21
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.46□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.46□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MT1XP80297 61 aa7.43□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.43□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MDN1Q9NU22 5596 aa7.43□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KMT2DO14686 5537 aa7.42□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 Q1T7F1 81 aa7.4□□□□□ -1.22
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LINC01554Q52M75 96 aa7.38□□□□□ -1.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCE1DQ5T752 114 aa7.37□□□□□ -1.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.37□□□□□ -1.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 COA5Q86WW8 74 aa7.34□□□□□ -1.23
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP12-2P59991 146 aa7.25□□□□□ -1.25
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.2□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.19□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2EP22531 72 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2BP35325 72 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2AP35326 72 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRO0628Q9UI54 55 aa7.18□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.17□□□□□ -1.26
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SEC61GP60059 68 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.14□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PSPHP1O15172 72 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRR15LQ9BU68 103 aa7.13□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BRK1Q8WUW1 75 aa7.12□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.09□□□□□ -1.27
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP10-12P60413 245 aa7.07□□□□□ -1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa7.05□□□□□ -1.28
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A1B0GU33 70 aa7.02□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A6NED7 52 aa7□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A1B0GU69 56 aa6.99□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.99□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LCE4AQ5TA78 99 aa6.99□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.98□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.98□□□□□ -1.29
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A0D9SG42 100 aa6.95□□□□□ -1.3
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPRR2DP22532 72 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 228.4 ms