RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417193.5

LINC00671-202, long intergenic non-protein coding RNA 671, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00671, Length 560 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00671-202ENST00000417193 LCA10Q71F78 164 aa7.73□□□□□ -1.17
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.71□□□□□ -1.18
LINC00671-202ENST00000417193 M0R2T5 61 aa7.7□□□□□ -1.18
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
LINC00671-202ENST00000417193 ACYP2P14621 99 aa7.68□□□□□ -1.18
LINC00671-202ENST00000417193 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
LINC00671-202ENST00000417193 PCP4P48539 62 aa7.63□□□□□ -1.19
LINC00671-202ENST00000417193 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
LINC00671-202ENST00000417193 TMEM258P61165 79 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00671-202ENST00000417193 CSAG1Q6PB30 78 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.59□□□□□ -1.19
LINC00671-202ENST00000417193 COA5Q86WW8 74 aa7.56□□□□□ -1.2
LINC00671-202ENST00000417193 MT2AP02795 61 aa7.53□□□□□ -1.2
LINC00671-202ENST00000417193 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.5□□□□□ -1.21
LINC00671-202ENST00000417193 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
LINC00671-202ENST00000417193 H0YAA0 97 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00671-202ENST00000417193 MT1FP04733 61 aa7.48□□□□□ -1.21
LINC00671-202ENST00000417193 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.46□□□□□ -1.22
LINC00671-202ENST00000417193 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.42□□□□□ -1.22
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP10-10P60014 251 aa7.38□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.35□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.34□□□□□ -1.23
LINC00671-202ENST00000417193 P0C880 135 aa7.29□□□□□ -1.24
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00671-202ENST00000417193 CRIPTQ9P021 101 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00671-202ENST00000417193 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00671-202ENST00000417193 LCE2BO14633 110 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00671-202ENST00000417193 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LINC00671-202ENST00000417193 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00671-202ENST00000417193 SEC61GP60059 68 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00671-202ENST00000417193 A0A1B0GU69 56 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00671-202ENST00000417193 R4GN34 69 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00671-202ENST00000417193 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 USH2AO75445 5202 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 M0QZ58 72 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 Q1T7F1 81 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 MT1BP07438 61 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 PRR15LQ9BU68 103 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 V9GYY9 64 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00671-202ENST00000417193 A0A1B0GU33 70 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00671-202ENST00000417193 Q5VV11 94 aa7□□□□□ -1.29
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.94□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.92□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 A6NN06 94 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 PSPHP1O15172 72 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 LINC01554Q52M75 96 aa6.9□□□□□ -1.3
LINC00671-202ENST00000417193 SSPOA2VEC9 5147 aa6.9□□□□□ -1.31
LINC00671-202ENST00000417193 UQCR11O14957 56 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.84□□□□□ -1.31
LINC00671-202ENST00000417193 A0A0D9SG42 100 aa6.8□□□□□ -1.32
LINC00671-202ENST00000417193 A8MU10 97 aa6.79□□□□□ -1.32
LINC00671-202ENST00000417193 PLAC4Q8WY50 150 aa6.79□□□□□ -1.32
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP12-1P59990 96 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP10-5P60370 271 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00671-202ENST00000417193 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP12-2P59991 146 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00671-202ENST00000417193 MT1XP80297 61 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00671-202ENST00000417193 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LINC00671-202ENST00000417193 A6NED7 52 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00671-202ENST00000417193 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00671-202ENST00000417193 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00671-202ENST00000417193 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00671-202ENST00000417193 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00671-202ENST00000417193 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00671-202ENST00000417193 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00671-202ENST00000417193 K7ERS5 55 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00671-202ENST00000417193 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.41□□□□□ -1.38
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP10-12P60413 245 aa6.38□□□□□ -1.39
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.37□□□□□ -1.39
LINC00671-202ENST00000417193 BRK1Q8WUW1 75 aa6.34□□□□□ -1.39
LINC00671-202ENST00000417193 KMT2DO14686 5537 aa6.27□□□□□ -1.41
LINC00671-202ENST00000417193 TNP1P09430 55 aa6.23□□□□□ -1.41
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.21□□□□□ -1.42
LINC00671-202ENST00000417193 ROMO1P60602 79 aa6.17□□□□□ -1.42
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.17□□□□□ -1.42
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.13□□□□□ -1.43
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP5-9P26371 169 aa6.12□□□□□ -1.43
LINC00671-202ENST00000417193 NEBP20929 6669 aa6.1□□□□□ -1.43
LINC00671-202ENST00000417193 LCE3AQ5TA76 89 aa6.08□□□□□ -1.44
LINC00671-202ENST00000417193 PRO0628Q9UI54 55 aa6.05□□□□□ -1.44
LINC00671-202ENST00000417193 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.04□□□□□ -1.44
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.03□□□□□ -1.44
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP23-1A1A580 65 aa6□□□□□ -1.45
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6□□□□□ -1.45
LINC00671-202ENST00000417193 PMAIP1Q13794 54 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00671-202ENST00000417193 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.98□□□□□ -1.45
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.94□□□□□ -1.46
LINC00671-202ENST00000417193 MT1EP04732 61 aa5.91□□□□□ -1.46
LINC00671-202ENST00000417193 PP632Q6XCG6 107 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00671-202ENST00000417193 MDN1Q9NU22 5596 aa5.86□□□□□ -1.47
LINC00671-202ENST00000417193 KRTAP12-3P60328 96 aa5.83□□□□□ -1.48
LINC00671-202ENST00000417193 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms