RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.55□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 V9GYY9 64 aa5.54□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCOTHQ58A44 107 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRK1Q8WUW1 75 aa5.53□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GVX0 72 aa5.52□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.48□□□□□ -1.53
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COA5Q86WW8 74 aa5.45□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PSPHP1O15172 72 aa5.43□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.43□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q75L30 129 aa5.43□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A8MUN3 132 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C8orf87E5RJ46 101 aa5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.41□□□□□ -1.54
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.4□□□□□ -1.54
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A8MUU9 505 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR15LQ9BU68 103 aa5.39□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00313P59037 77 aa5.38□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.35□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HRES1P13985 223 aa5.34□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.34□□□□□ -1.55
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.33□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q5W150 140 aa5.32□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT1HP80294 61 aa5.31□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.31□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.3□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A6NED7 52 aa5.28□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ACYP2P14621 99 aa5.28□□□□□ -1.56
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV2-30P06310 120 aa5.27□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DMAC1Q96GE9 116 aa5.27□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.26□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PMAIP1Q13794 54 aa5.25□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCA10Q71F78 164 aa5.23□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A8MU10 97 aa5.22□□□□□ -1.57
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 M0R2T5 61 aa5.21□□□□□ -1.58
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.19□□□□□ -1.58
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPINK7P58062 85 aa5.18□□□□□ -1.58
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A6NN06 94 aa5.17□□□□□ -1.58
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.15□□□□□ -1.59
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GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GU69 56 aa5.13□□□□□ -1.59
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.12□□□□□ -1.59
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SEC61GP60059 68 aa5.1□□□□□ -1.59
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.06□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UQCR11O14957 56 aa5.04□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.03□□□□□ -1.6
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT2AP02795 61 aa4.99□□□□□ -1.61
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT1FP04733 61 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.95□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.93□□□□□ -1.62
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-10P60014 251 aa4.9□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRAC1Q96KF2 57 aa4.86□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USH2AO75445 5202 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GU33 70 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H0YAA0 97 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 S4R3F8 94 aa4.84□□□□□ -1.63
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.83□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSPOA2VEC9 5147 aa4.8□□□□□ -1.64
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0A0MQY5 61 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01554Q52M75 96 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CSAG1Q6PB30 78 aa4.75□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 K7ERS5 55 aa4.74□□□□□ -1.65
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ROMO1P60602 79 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT1BP07438 61 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0D9SG42 100 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 P0C880 135 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRIPTQ9P021 101 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 M0QZ58 72 aa4.49□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP12-1P59990 96 aa4.46□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP12-2P59991 146 aa4.46□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-5P60370 271 aa4.43□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.42□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 R4GN34 69 aa4.42□□□□□ -1.7
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.35□□□□□ -1.71
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLAC4Q8WY50 150 aa4.33□□□□□ -1.72
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT1XP80297 61 aa4.31□□□□□ -1.72
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