RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 MUC17Q685J3 4493 aa10.83□□□□□ -0.68
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SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.93□□□□□ -1.14
SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFAF8A1L188 74 aa7.8□□□□□ -1.16
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SH3BP5-204ENST00000412806 LUZP6Q538Z0 58 aa7.72□□□□□ -1.17
SH3BP5-204ENST00000412806 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.7□□□□□ -1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.68□□□□□ -1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MT1LQ93083 61 aa7.65□□□□□ -1.18
SH3BP5-204ENST00000412806 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.52□□□□□ -1.2
SH3BP5-204ENST00000412806 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.5□□□□□ -1.21
SH3BP5-204ENST00000412806 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.45□□□□□ -1.22
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