RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317096.8

PARL-202, Transcript of presenilin associated rhomboid like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PARL, Length 1,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARL-202ENST00000317096 A8MUN3 132 aa11.26□□□□□ -0.61
PARL-202ENST00000317096 CSAG1Q6PB30 78 aa11.22□□□□□ -0.61
PARL-202ENST00000317096 SERP2Q8N6R1 65 aa11.21□□□□□ -0.61
PARL-202ENST00000317096 LCE2BO14633 110 aa11.18□□□□□ -0.62
PARL-202ENST00000317096 DMAC1Q96GE9 116 aa11.18□□□□□ -0.62
PARL-202ENST00000317096 SNURFQ9Y675 71 aa11.15□□□□□ -0.62
PARL-202ENST00000317096 USH2AO75445 5202 aa11.09□□□□□ -0.63
PARL-202ENST00000317096 C20orf197Q8N268 126 aa11.09□□□□□ -0.63
PARL-202ENST00000317096 NDUFC1O43677 76 aa11.04□□□□□ -0.64
PARL-202ENST00000317096 COX7CP15954 63 aa11.01□□□□□ -0.65
PARL-202ENST00000317096 SSPOA2VEC9 5147 aa10.98□□□□□ -0.65
PARL-202ENST00000317096 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa10.97□□□□□ -0.65
PARL-202ENST00000317096 H0YAA0 97 aa10.93□□□□□ -0.66
PARL-202ENST00000317096 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.93□□□□□ -0.66
PARL-202ENST00000317096 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.91□□□□□ -0.66
PARL-202ENST00000317096 ACYP2P14621 99 aa10.9□□□□□ -0.66
PARL-202ENST00000317096 SPRR2GQ9BYE4 73 aa10.85□□□□□ -0.67
PARL-202ENST00000317096 ANAPC13Q9BS18 74 aa10.8□□□□□ -0.68
PARL-202ENST00000317096 H7BZZ5 65 aa10.79□□□□□ -0.68
PARL-202ENST00000317096 ADM2Q7Z4H4 148 aa10.77□□□□□ -0.68
PARL-202ENST00000317096 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.75□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10.73□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 CRIPTQ9P021 101 aa10.72□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa10.71□□□□□ -0.69
PARL-202ENST00000317096 MT1BP07438 61 aa10.69□□□□□ -0.7
PARL-202ENST00000317096 P0C880 135 aa10.69□□□□□ -0.7
PARL-202ENST00000317096 CCDC179H3BU77 68 aa10.67□□□□□ -0.7
PARL-202ENST00000317096 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.61□□□□□ -0.71
PARL-202ENST00000317096 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa10.59□□□□□ -0.71
PARL-202ENST00000317096 COA5Q86WW8 74 aa10.58□□□□□ -0.72
PARL-202ENST00000317096 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.58□□□□□ -0.72
PARL-202ENST00000317096 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
PARL-202ENST00000317096 Q5VV11 94 aa10.54□□□□□ -0.72
PARL-202ENST00000317096 R4GN34 69 aa10.41□□□□□ -0.74
PARL-202ENST00000317096 M0QZ58 72 aa10.38□□□□□ -0.75
PARL-202ENST00000317096 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PARL-202ENST00000317096 A6NN06 94 aa10.33□□□□□ -0.76
PARL-202ENST00000317096 KRTAP10-5P60370 271 aa10.29□□□□□ -0.76
PARL-202ENST00000317096 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PARL-202ENST00000317096 TMEM258P61165 79 aa10.22□□□□□ -0.77
PARL-202ENST00000317096 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa10.22□□□□□ -0.77
PARL-202ENST00000317096 LINC01554Q52M75 96 aa10.16□□□□□ -0.78
PARL-202ENST00000317096 MT1XP80297 61 aa10.13□□□□□ -0.79
PARL-202ENST00000317096 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa10.11□□□□□ -0.79
PARL-202ENST00000317096 PLAC4Q8WY50 150 aa10.1□□□□□ -0.79
PARL-202ENST00000317096 SEC61GP60059 68 aa10.06□□□□□ -0.8
PARL-202ENST00000317096 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.06□□□□□ -0.8
PARL-202ENST00000317096 A0A1B0GU33 70 aa9.98□□□□□ -0.81
PARL-202ENST00000317096 A0A1B0GU69 56 aa9.96□□□□□ -0.82
PARL-202ENST00000317096 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.94□□□□□ -0.82
PARL-202ENST00000317096 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.93□□□□□ -0.82
PARL-202ENST00000317096 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.91□□□□□ -0.82
PARL-202ENST00000317096 PCP4P48539 62 aa9.85□□□□□ -0.83
PARL-202ENST00000317096 A0A0D9SG42 100 aa9.79□□□□□ -0.84
PARL-202ENST00000317096 NEBP20929 6669 aa9.76□□□□□ -0.85
PARL-202ENST00000317096 KRTAP12-2P59991 146 aa9.74□□□□□ -0.85
PARL-202ENST00000317096 KRTAP12-1P59990 96 aa9.73□□□□□ -0.85
PARL-202ENST00000317096 PRR15LQ9BU68 103 aa9.73□□□□□ -0.85
PARL-202ENST00000317096 A8MU10 97 aa9.68□□□□□ -0.86
PARL-202ENST00000317096 KRTAP5-9P26371 169 aa9.68□□□□□ -0.86
PARL-202ENST00000317096 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PARL-202ENST00000317096 KMT2DO14686 5537 aa9.65□□□□□ -0.86
PARL-202ENST00000317096 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.63□□□□□ -0.87
PARL-202ENST00000317096 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.63□□□□□ -0.87
PARL-202ENST00000317096 KRTAP10-12P60413 245 aa9.61□□□□□ -0.87
PARL-202ENST00000317096 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.59□□□□□ -0.87
PARL-202ENST00000317096 Q1T7F1 81 aa9.58□□□□□ -0.88
PARL-202ENST00000317096 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.58□□□□□ -0.88
PARL-202ENST00000317096 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.54□□□□□ -0.88
PARL-202ENST00000317096 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.54□□□□□ -0.88
PARL-202ENST00000317096 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
PARL-202ENST00000317096 UQCR11O14957 56 aa9.49□□□□□ -0.89
PARL-202ENST00000317096 V9GYY9 64 aa9.49□□□□□ -0.89
PARL-202ENST00000317096 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.48□□□□□ -0.89
PARL-202ENST00000317096 SPRR2FQ96RM1 72 aa9.46□□□□□ -0.9
PARL-202ENST00000317096 PSPHP1O15172 72 aa9.45□□□□□ -0.9
PARL-202ENST00000317096 MDN1Q9NU22 5596 aa9.37□□□□□ -0.91
PARL-202ENST00000317096 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.33□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa9.33□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 SPRR2EP22531 72 aa9.3□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 SPRR2BP35325 72 aa9.3□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 SPRR2AP35326 72 aa9.3□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.29□□□□□ -0.92
PARL-202ENST00000317096 LCE1AQ5T7P2 110 aa9.15□□□□□ -0.94
PARL-202ENST00000317096 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa9.12□□□□□ -0.95
PARL-202ENST00000317096 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.12□□□□□ -0.95
PARL-202ENST00000317096 A6NED7 52 aa9.08□□□□□ -0.96
PARL-202ENST00000317096 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.07□□□□□ -0.96
PARL-202ENST00000317096 TNP1P09430 55 aa9.01□□□□□ -0.97
PARL-202ENST00000317096 SPRR2DP22532 72 aa8.99□□□□□ -0.97
PARL-202ENST00000317096 K7ERS5 55 aa8.92□□□□□ -0.98
PARL-202ENST00000317096 MT1EP04732 61 aa8.92□□□□□ -0.98
PARL-202ENST00000317096 LCE3AQ5TA76 89 aa8.92□□□□□ -0.98
PARL-202ENST00000317096 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.89□□□□□ -0.99
PARL-202ENST00000317096 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.85□□□□□ -0.99
PARL-202ENST00000317096 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.83□□□□□ -1
PARL-202ENST00000317096 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.83□□□□□ -1
PARL-202ENST00000317096 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.5 ms