RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 LINC01554Q52M75 96 aa5.52□□□□□ -1.53
PDCL-201ENST00000259467 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.51□□□□□ -1.53
PDCL-201ENST00000259467 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.48□□□□□ -1.53
PDCL-201ENST00000259467 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.45□□□□□ -1.54
PDCL-201ENST00000259467 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.45□□□□□ -1.54
PDCL-201ENST00000259467 HERC1Q15751 4861 aa5.44□□□□□ -1.54
PDCL-201ENST00000259467 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.39□□□□□ -1.55
PDCL-201ENST00000259467 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.38□□□□□ -1.55
PDCL-201ENST00000259467 A8MUU9 505 aa5.38□□□□□ -1.55
PDCL-201ENST00000259467 MT1HL1P0DM35 61 aa5.38□□□□□ -1.55
PDCL-201ENST00000259467 CSAG1Q6PB30 78 aa5.38□□□□□ -1.55
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-8P60410 259 aa5.35□□□□□ -1.55
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PDCL-201ENST00000259467 J3QL48 77 aa5.3□□□□□ -1.56
PDCL-201ENST00000259467 LRP2P98164 4655 aa5.26□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 C9orf92A6NGG3 77 aa5.26□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.25□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.24□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.24□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.24□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 H0YAA0 97 aa5.24□□□□□ -1.57
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PDCL-201ENST00000259467 A0A1B0GU33 70 aa5.21□□□□□ -1.57
PDCL-201ENST00000259467 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.18□□□□□ -1.58
PDCL-201ENST00000259467 K7ERS5 55 aa5.17□□□□□ -1.58
PDCL-201ENST00000259467 ROMO1P60602 79 aa5.17□□□□□ -1.58
PDCL-201ENST00000259467 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.15□□□□□ -1.59
PDCL-201ENST00000259467 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.13□□□□□ -1.59
PDCL-201ENST00000259467 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
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PDCL-201ENST00000259467 XP32Q5T750 250 aa5.11□□□□□ -1.59
PDCL-201ENST00000259467 RNF213Q63HN8 5207 aa5.07□□□□□ -1.6
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 TPRXLQ17RH7 258 aa4.99□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 CRIPTQ9P021 101 aa4.99□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.99□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 A0A0A0MQY5 61 aa4.98□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 P0C880 135 aa4.96□□□□□ -1.61
PDCL-201ENST00000259467 S4R3F8 94 aa4.93□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.92□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 MUC17Q685J3 4493 aa4.92□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.91□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.91□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.91□□□□□ -1.62
PDCL-201ENST00000259467 A0A0D9SG42 100 aa4.88□□□□□ -1.63
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.87□□□□□ -1.63
PDCL-201ENST00000259467 LCE3BQ5TA77 95 aa4.83□□□□□ -1.64
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.82□□□□□ -1.64
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PDCL-201ENST00000259467 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.82□□□□□ -1.64
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.8□□□□□ -1.64
PDCL-201ENST00000259467 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.79□□□□□ -1.64
PDCL-201ENST00000259467 NDUFAF8A1L188 74 aa4.77□□□□□ -1.65
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.74□□□□□ -1.65
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP12-1P59990 96 aa4.73□□□□□ -1.65
PDCL-201ENST00000259467 M0QZ58 72 aa4.72□□□□□ -1.65
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.71□□□□□ -1.66
PDCL-201ENST00000259467 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PDCL-201ENST00000259467 LCE2CQ5TA81 110 aa4.64□□□□□ -1.67
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.59□□□□□ -1.67
PDCL-201ENST00000259467 LCE2BO14633 110 aa4.56□□□□□ -1.68
PDCL-201ENST00000259467 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PDCL-201ENST00000259467 MT1HP80294 61 aa4.55□□□□□ -1.68
PDCL-201ENST00000259467 R4GN34 69 aa4.53□□□□□ -1.68
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.53□□□□□ -1.68
PDCL-201ENST00000259467 LCE1DQ5T752 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PDCL-201ENST00000259467 M0R2T5 61 aa4.51□□□□□ -1.69
PDCL-201ENST00000259467 PLAC4Q8WY50 150 aa4.51□□□□□ -1.69
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.51□□□□□ -1.69
PDCL-201ENST00000259467 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PDCL-201ENST00000259467 PP632Q6XCG6 107 aa4.44□□□□□ -1.7
PDCL-201ENST00000259467 LUZP6Q538Z0 58 aa4.42□□□□□ -1.7
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PDCL-201ENST00000259467 MT1FP04733 61 aa4.33□□□□□ -1.72
PDCL-201ENST00000259467 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.33□□□□□ -1.72
PDCL-201ENST00000259467 USH2AO75445 5202 aa4.31□□□□□ -1.72
PDCL-201ENST00000259467 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.31□□□□□ -1.72
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-10P60014 251 aa4.3□□□□□ -1.72
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.19□□□□□ -1.74
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PDCL-201ENST00000259467 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.17□□□□□ -1.74
PDCL-201ENST00000259467 SSPOA2VEC9 5147 aa4.13□□□□□ -1.75
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.13□□□□□ -1.75
PDCL-201ENST00000259467 MT1BP07438 61 aa4.04□□□□□ -1.76
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-5P60370 271 aa3.99□□□□□ -1.77
PDCL-201ENST00000259467 MT1XP80297 61 aa3.99□□□□□ -1.77
PDCL-201ENST00000259467 LCE3AQ5TA76 89 aa3.96□□□□□ -1.78
PDCL-201ENST00000259467 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.96□□□□□ -1.78
PDCL-201ENST00000259467 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.94□□□□□ -1.78
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