RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem190Q9D2E9 166 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dock11A2AF47 2073 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dennd4aE9Q8V6 1869 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv3-8A0A075B5T0 131 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 OtorQ9JIE3 128 aa8.73□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav3n-3A0A0G2JEM0 114 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Myod1P10085 318 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyyr1Q8VIH7 165 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem170aQ9D342 144 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr745Q7TRL9 328 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC049762Q8C601 163 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm19410A0A140LJC7 2098 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01643 108 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Defa4P28311 92 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q9D8L0 127 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Abca7Q91V24 2159 aa8.72□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa8.71□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tm2d3Q8BJ83 261 aa8.71□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav14n-3A0A075B645 120 aa8.71□□□□□ -1.01
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ca5aP23589 299 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdkn2aQ64364 169 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf740Q6NZQ6 180 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 UrahQ9CRB3 118 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cacna1hO88427 2365 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nup214Q80U93 2085 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shisal1Q0VBP7 198 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc25a47Q6IS41 310 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf144bQ8BKD6 301 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wt1P22561 449 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lamtor2Q9JHS3 125 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SelenokQ9JLJ1 94 aa8.71□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ptprz1B9EKR1 2312 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tcf20Q9EPQ8 1987 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm6034E9Q101 117 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm19684G3UZ45 117 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr975Q8VG91 310 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lcn2P11672 200 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pcp4P63054 62 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prok1Q14A28 105 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P04945 108 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm21616B6ZB74 166 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Samd10Q7TST3 202 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BC048502Q80Y74 154 aa8.7□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nxph4G3X9N5 304 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Asxl3Q8C4A5 2259 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 NrgnP60761 78 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znrd1Q791N7 123 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm26938S4R185 226 aa8.69□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm6793B2RXM2 351 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp1r32Q148A4 427 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm10306Q9CUK2 115 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LbhQ9CX60 105 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PmvkQ9D1G2 192 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PpbpQ9EQI5 113 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Phf3B2RQG2 2025 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smlr1J3QMJ4 66 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lyzl1Q9CPX3 148 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pex7P97865 318 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SprnQ8BWU1 147 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klk11Q9QYN3 276 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Col24a1Q30D77 1733 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trav9d-1A0A075B699 112 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ss18l2Q9D174 77 aa8.68□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MalO09198 153 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem256Q5F285 113 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Foxc1Q61572 553 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Exph5Q0VAV2 1960 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm20458E9PXJ7 78 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gdf15Q9Z0J7 303 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bex1Q9R224 128 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Shank1D3YZU1 2167 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cox17P56394 63 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q08AU9 97 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GgctQ9D7X8 188 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv5-6A0A075B5Q0 117 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01745 121 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hoxb4P10284 250 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4861Q8C5A4 106 aa8.67□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LtbP41155 306 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm13030A2APQ6 143 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ndufa1O35683 70 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Anapc13Q8R034 74 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pglyrp1O88593 182 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm20499D3Z4G5 72 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01896 185 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist1h2bmP10854 126 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ang5Q5GAN1 145 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist1h2bhQ64478 126 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist2h2bbQ64525 126 aa8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa8.65□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm29289A0A087WPY7 166 aa8.65□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Esp24A8R0V6 68 aa8.65□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 FshbQ60687 130 aa8.65□□□□□ -1.02
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gnb1lQ9EQ15 326 aa8.65□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 514.7 ms