RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Clpsl2Q3UW21 102 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr313Q5NC55 308 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm10334Q792Y8 246 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pygo2Q80V76 405 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cldn34c1Q8K193 234 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fmc1Q9CR13 113 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm12728V9GX31 77 aa7.24□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21882J3QN86 361 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21310J3QQ23 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P01787 123 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pate4Q09098 99 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21394Q497R7 227 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Smim7Q5RKS2 75 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr147Q60886 317 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Naa38Q9D2U5 125 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm20873J3QMQ9 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm20795J3QP49 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SdcbpO08992 299 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tnfsf12O54907 249 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Syngr2O55101 224 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ssty1P13675 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igll1P20764 209 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Evi2aP20934 223 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21440Q3TTD8 232 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr965Q7TRA7 312 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr493Q8VEW5 314 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mrpl3Q99N95 348 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 2200002J24RikQ9D807 110 aa7.23□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21974F6W3F3 119 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ly86O88188 162 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cr2P19070 1025 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Smrp1Q2MH31 260 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q9DAB9 146 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav4-2A0A075B638 110 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm28269A0A087WSG3 125 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Efnb3O35393 340 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 S100a10P08207 97 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zglp1Q1WG82 266 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vmn1r195Q5SVD6 316 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr150Q60895 312 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr1457Q8VFK3 317 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ifitm2Q99J93 144 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ssbp1Q9CYR0 152 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr894Q9EQB2 313 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trbv1A0A0B4J1G7 116 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr779E9PUS9 130 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Thy1P01831 162 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ClcP97400 68 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trdv4Q5R1A3 115 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Slc35d2Q762D5 326 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mettl26Q9DCS2 204 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gvin1Q80SU7 2427 aa7.22□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm4064A0A087WR82 380 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv1-36A0A0A6YXT2 117 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vma21-psA0A140T8R2 101 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm14325A2AW67 498 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr221B2RVX8 311 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Emp2O88662 172 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tmem241Q3UME2 297 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trem3Q9JKE1 183 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pla2g2eQ9QUL3 142 aa7.21□□□□□ -1.25
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 DysfQ9ESD7 2090 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv5-17A0A075B5R1 117 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv14-111A0A140T8P9 117 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gata2O09100 480 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hes1P35428 282 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pax8Q00288 457 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr1367Q8VFG2 316 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Il25Q8VHH8 169 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Znf672Q99LH4 468 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 CadB2RQC6 2225 aa7.21□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Col6a6Q8C6K9 2265 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mpv17P19258 176 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Il3raP26952 396 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm10384Q3UQ87 92 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Slc17a2Q5SZA1 478 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Znf329Q6GQR8 522 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Smim19Q80ZU4 107 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rasl10aQ8K5A4 203 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 RtbdnQ8QZY4 247 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 RetnQ99P87 114 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Chchd1Q9CQA6 118 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv4-80A0A075B5L7 116 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav6-1A0A075B5Z8 112 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav12d-3A0A075B6A4 115 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Iglc1A0A0G2JE99 106 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm20422E9PUR3 255 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 C530025M09RikF6RGA8 229 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fcer1gP20491 86 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa3P28310 93 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gnb4P29387 340 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa10P50708 93 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa15P50713 93 aa7.2□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ubald1Q6P3B2 176 aa7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 45.2 ms