Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Syngr2O55101 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Syngr2O55101 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Syngr2O55101 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Syngr2O55101 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Syngr2O55101 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Syngr2O55101 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Syngr2O55101 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Syngr2O55101 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Syngr2O55101 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Syngr2O55101 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Syngr2O55101 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Syngr2O55101 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Syngr2O55101 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Syngr2O55101 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24,54■■□□□ 1,52
Syngr2O55101 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Syngr2O55101 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Syngr2O55101 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Syngr2O55101 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Syngr2O55101 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Syngr2O55101 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Syngr2O55101 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Syngr2O55101 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Syngr2O55101 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Syngr2O55101 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,02■■□□□ 1,44
Syngr2O55101 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Syngr2O55101 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Syngr2O55101 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Syngr2O55101 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23,76■■□□□ 1,39
Syngr2O55101 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Syngr2O55101 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Syngr2O55101 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,71■■□□□ 1,39
Syngr2O55101 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Syngr2O55101 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Syngr2O55101 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Syngr2O55101 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,49■■□□□ 1,35
Syngr2O55101 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Syngr2O55101 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Syngr2O55101 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Syngr2O55101 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Syngr2O55101 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Syngr2O55101 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Syngr2O55101 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23,31■■□□□ 1,32
Syngr2O55101 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Syngr2O55101 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Syngr2O55101 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Syngr2O55101 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Syngr2O55101 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Syngr2O55101 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Syngr2O55101 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Syngr2O55101 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Syngr2O55101 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Syngr2O55101 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Syngr2O55101 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,9■■□□□ 1,26
Syngr2O55101 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Syngr2O55101 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Syngr2O55101 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Syngr2O55101 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Syngr2O55101 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Syngr2O55101 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Syngr2O55101 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22,76■■□□□ 1,23
Syngr2O55101 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Syngr2O55101 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,7■■□□□ 1,23
Syngr2O55101 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Syngr2O55101 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Syngr2O55101 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Syngr2O55101 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,62■■□□□ 1,21
Syngr2O55101 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Syngr2O55101 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Syngr2O55101 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Syngr2O55101 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Syngr2O55101 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22,53■■□□□ 1,2
Syngr2O55101 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Syngr2O55101 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Syngr2O55101 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22,45■■□□□ 1,18
Syngr2O55101 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Syngr2O55101 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Syngr2O55101 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
Syngr2O55101 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Syngr2O55101 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Syngr2O55101 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Syngr2O55101 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Syngr2O55101 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Syngr2O55101 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Syngr2O55101 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Syngr2O55101 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,23■■□□□ 1,15
Syngr2O55101 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Syngr2O55101 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Syngr2O55101 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
Syngr2O55101 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Syngr2O55101 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Syngr2O55101 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Syngr2O55101 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Syngr2O55101 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Syngr2O55101 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Syngr2O55101 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Syngr2O55101 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Syngr2O55101 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Syngr2O55101 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Syngr2O55101 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,95■■□□□ 1,1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 6,9 ms