Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syngr2O55101 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Syngr2O55101 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Syngr2O55101 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Syngr2O55101 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Syngr2O55101 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Syngr2O55101 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Syngr2O55101 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngr2O55101 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngr2O55101 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syngr2O55101 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syngr2O55101 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syngr2O55101 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syngr2O55101 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syngr2O55101 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syngr2O55101 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Syngr2O55101 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syngr2O55101 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syngr2O55101 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syngr2O55101 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syngr2O55101 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Syngr2O55101 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Syngr2O55101 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Syngr2O55101 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Syngr2O55101 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Syngr2O55101 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syngr2O55101 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syngr2O55101 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syngr2O55101 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Syngr2O55101 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngr2O55101 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syngr2O55101 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syngr2O55101 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syngr2O55101 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syngr2O55101 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syngr2O55101 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngr2O55101 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngr2O55101 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngr2O55101 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngr2O55101 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syngr2O55101 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngr2O55101 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syngr2O55101 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syngr2O55101 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syngr2O55101 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syngr2O55101 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syngr2O55101 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syngr2O55101 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Syngr2O55101 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr2O55101 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syngr2O55101 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Syngr2O55101 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Syngr2O55101 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Syngr2O55101 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Syngr2O55101 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Syngr2O55101 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Syngr2O55101 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Syngr2O55101 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syngr2O55101 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syngr2O55101 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngr2O55101 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngr2O55101 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syngr2O55101 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syngr2O55101 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syngr2O55101 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngr2O55101 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syngr2O55101 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Syngr2O55101 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Syngr2O55101 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Syngr2O55101 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr2O55101 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Syngr2O55101 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr2O55101 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Syngr2O55101 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Syngr2O55101 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr2O55101 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Syngr2O55101 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Syngr2O55101 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Syngr2O55101 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Syngr2O55101 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr2O55101 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr2O55101 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Syngr2O55101 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Syngr2O55101 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Syngr2O55101 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syngr2O55101 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syngr2O55101 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syngr2O55101 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syngr2O55101 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syngr2O55101 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syngr2O55101 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syngr2O55101 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr2O55101 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr2O55101 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syngr2O55101 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Syngr2O55101 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Syngr2O55101 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr2O55101 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Syngr2O55101 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Syngr2O55101 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms