RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364877.1

RNU6-534P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 534, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-534P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-534P-201ENST00000364877 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 STAB1Q9NY15 2570 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 I3L3M4 83 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 S100A10P60903 97 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 GNGT1P63211 74 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 C6orf201Q7Z4U5 140 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 AP4S1Q9Y587 144 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 TOP2BQ02880 1626 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-534P-201ENST00000364877 PTPN13Q12923 2485 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 H3BQF6 201 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MT-ATP8P03928 68 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPRR2BP35325 72 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRGV9Q99603 122 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 NRKQ7Z2Y5 1582 aa-0.29□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCC5O15440 1437 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 TMEM218A2RU14 115 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PMCHL1Q16048 86 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.3□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 H0Y9P7 68 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 LELP1Q5T871 98 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 HEPN1Q6WQI6 88 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 C14orf144Q96I85 54 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 KNDC1Q76NI1 1749 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 KIAA0556O60303 1618 aa-0.31□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 ZANQ9Y493 2812 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 COL4A6Q14031 1691 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 NDUFC1O43677 76 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 UQCRHP07919 91 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 S100PP25815 95 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 FAUP35544 74 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFB135Q30KP9 77 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SVEP1Q4LDE5 3571 aa-0.32□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 NUP188Q5SRE5 1749 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAPKBP1O60336 1514 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 H7BZZ5 65 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 LEPROTL1O95214 131 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 A0A0G2JMZ2 1700 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 MPC2O95563 127 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 NCMAPQ5T1S8 102 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PSENENQ9NZ42 101 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SLIT1O75093 1534 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 APC2O95996 2303 aa-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.35□□□□□ -2.46
RNU6-534P-201ENST00000364877 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 D6R8Y8 96 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 F8WEM9 126 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ATOX1O00244 68 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 IGLC2P0DOY2 106 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 IGLC3P0DOY3 106 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 RBP2P50120 134 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 MUSTN1Q8IVN3 82 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 SERP2Q8N6R1 65 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CCDC141Q6ZP82 1450 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ABCA3Q99758 1704 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 ANKRD36A6QL64 1941 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 WFDC13Q8IUB5 93 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 C9orf62Q8N4C0 152 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 CHD1O14646 1710 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 COL6A3P12111 3177 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-534P-201ENST00000364877 DNAJC13O75165 2243 aa-0.37□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms